More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1870 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  187  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  72.22 
 
 		 91 aa  140  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  70 
 
 		 91 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0397  histone family protein DNA-binding protein  71.11 
 
 		 91 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1299  histone family protein DNA-binding protein  69.23 
 
 		 93 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184081  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1783  histone family protein DNA-binding protein  72.22 
 
 		 91 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1012  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 91 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000010655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0558  histone family protein DNA-binding protein  70 
 
 		 91 aa  130  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235916 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  68.13 
 
 		 91 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  54.95 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  55.56 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 93 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2060  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0740  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0698  histone-like DNA-binding protein  51.65 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151806  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0734  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0733  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.721245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1850  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 93 aa  104  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1781  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.88683  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  49.45 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 100 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  44.44 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  48.91 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  48.35 
 
 		 96 aa  93.6  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  48.91 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  48.91 
 
 		 102 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  41.76 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  48.91 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  48.35 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 93 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 93 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 95 aa  91.7  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 98 aa  90.9  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 101 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  44.44 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  40.66 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  37.78 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  41.76 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>