More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0165 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 93 aa  184  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  69.57 
 
 		 92 aa  134  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2409  histone family protein DNA-binding protein  68.48 
 
 		 92 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  63.04 
 
 		 93 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  63.04 
 
 		 93 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  59.14 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  61.96 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  58.7 
 
 		 95 aa  115  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  58.7 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  58.24 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  57.61 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0104  integration host factor subunit beta  60.22 
 
 		 94 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  58.06 
 
 		 101 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  59.34 
 
 		 110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  58.24 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  58.24 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  56.99 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  55.43 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  56.99 
 
 		 104 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  56.99 
 
 		 101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  57.14 
 
 		 92 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5215  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243034  normal  0.450992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  57.14 
 
 		 96 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  57.14 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  57.14 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  57.14 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  56.04 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  57.14 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  57.61 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  56.04 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  56.04 
 
 		 102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  55.43 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 103 aa  107  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  55.43 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  55.43 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  48.91 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  46.24 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  47.31 
 
 		 96 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  45.65 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  46.24 
 
 		 98 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  47.83 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  43.48 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  47.31 
 
 		 96 aa  94  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  44.57 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0501  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525141  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1596  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.878202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  47.25 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  47.31 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  47.31 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0957  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00640345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  46.15 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 94 aa  92  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000516669  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6976  hypothetical protein  52.75 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  43.48 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  46.15 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  42.39 
 
 		 92 aa  91.3  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1647  integration host factor subunit beta  42.39 
 
 		 101 aa  91.3  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0979657  normal  0.0681876 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 93 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5428  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 94 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 101 aa  90.9  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2222  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 93 aa  90.5  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000109165  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 101 aa  90.9  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 95 aa  90.5  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2401  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2297  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000102507  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000261968  unclonable  0.000000000047672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1539  integration host factor subunit beta  43.48 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1925  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000515528  unclonable  0.0000000000266845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2053  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000159286  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00916  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2731  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00160452  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1047  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 94 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.788464 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1955  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000468135  unclonable  0.00000320833 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1018  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000522422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2416  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000431379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  42.86 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2312  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 95 aa  88.6  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000159711  hitchhiker  0.000000300932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1073  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0306564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1095  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 94 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.939272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2208  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000105854  normal  0.266842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2122  integration host factor subunit beta  43.48 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000593472  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0988  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 94 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.165109  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2684  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193078  normal  0.358809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>