More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1890 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1890  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.469333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2060  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  114  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1781  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.88683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1850  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  53.93 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  52.81 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  52.81 
 
 		 92 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  53.41 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 96 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 93 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 93 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1299  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184081  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  51.58 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  50.57 
 
 		 91 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1012  histone family protein DNA-binding protein  52.94 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000010655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 92 aa  86.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  48.89 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  48.31 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1955  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000468135  unclonable  0.00000320833 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2122  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000593472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2401  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2312  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000159711  hitchhiker  0.000000300932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  50 
 
 		 94 aa  84.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000261968  unclonable  0.000000000047672 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1754  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014676  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1925  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000515528  unclonable  0.0000000000266845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2053  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000159286  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  52.22 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2278  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000837765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2395  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000343473  unclonable  0.00000762549 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2071  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2067  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000478736  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  47.78 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2297  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000102507  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0558  histone family protein DNA-binding protein  48.28 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235916 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  83.6  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  83.6  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  83.6  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2222  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 93 aa  84  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000109165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  83.6  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2409  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  48.89 
 
 		 95 aa  83.6  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  48.89 
 
 		 95 aa  83.6  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  41.57 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1544  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000007734  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  45.56 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3065  transcriptional regulator HU subunit beta  41.57 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5215  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.243034  normal  0.450992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  47.78 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  47.78 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00916  integration host factor subunit beta  48.31 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2731  integration host factor, beta subunit  48.31 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00160452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  43.33 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1009  integration host factor subunit beta  48.31 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000570398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  43.33 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  47.78 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2684  integration host factor subunit beta  48.31 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193078  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2416  integration host factor subunit beta  48.31 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000431379  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1018  integration host factor subunit beta  48.31 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000522422  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00923  hypothetical protein  48.31 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.294308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1073  integration host factor subunit beta  48.31 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0306564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  47.78 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2208  integration host factor subunit beta  48.31 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000105854  normal  0.266842 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  47.78 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2658  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000180426  normal  0.730265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>