More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2156 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2060  histone family protein DNA-binding protein  98.9 
 
 		 91 aa  176  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  83.33 
 
 		 91 aa  154  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  73.63 
 
 		 93 aa  140  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  75.56 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1850  histone family protein DNA-binding protein  71.91 
 
 		 93 aa  137  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  68.89 
 
 		 92 aa  133  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1781  histone family protein DNA-binding protein  67.42 
 
 		 91 aa  133  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.88683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1890  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.469333  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1012  histone family protein DNA-binding protein  65.88 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000010655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 106 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  59.77 
 
 		 91 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1299  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184081  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1783  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0558  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0397  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  55.43 
 
 		 95 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  53.26 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  57.14 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  53.26 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0740  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0734  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0698  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151806  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0733  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.721245  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  47.83 
 
 		 96 aa  98.2  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 102 aa  97.8  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 95 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 95 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  48.91 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  48.91 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  51.69 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  53.33 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  51.11 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  47.83 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  94.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  94.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  48.91 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 94 aa  94.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  53.33 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  48.86 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 94 aa  94  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  51.65 
 
 		 93 aa  94  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 108 aa  93.6  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 96 aa  93.6  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  50 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  46.67 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  45.65 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  48.91 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  46.74 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 94 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>