More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1783 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1783  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0397  histone family protein DNA-binding protein  81.32 
 
 		 91 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  72.53 
 
 		 91 aa  141  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1299  histone family protein DNA-binding protein  72.22 
 
 		 93 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184081  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  67.78 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0558  histone family protein DNA-binding protein  68.89 
 
 		 91 aa  133  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235916 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  72.22 
 
 		 91 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  67.78 
 
 		 91 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1012  histone family protein DNA-binding protein  63.33 
 
 		 91 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000010655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  58.62 
 
 		 91 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  57.47 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2060  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 91 aa  104  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  55.17 
 
 		 93 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  55.17 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  53.33 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 168 aa  98.2  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1850  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  48.35 
 
 		 95 aa  90.5  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  46.67 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0733  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.721245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0734  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0698  histone-like DNA-binding protein  46.67 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 91 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0740  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1781  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.88683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  40 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 106 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  88.2  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  48.35 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 95 aa  87.8  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  44.94 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  44.83 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  43.33 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_66  DNA-binding protein HU-alpha  46.15 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0113448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  39.08 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  39.08 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  39.08 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  39.08 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  39.08 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  39.08 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  39.08 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  37.93 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  39.33 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  39.08 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  39.08 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  51.14 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  48.35 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  51.14 
 
 		 142 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  51.14 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  46.59 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  84.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  37.93 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  38.2 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  38.2 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>