More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4105 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  100 
 
 		 110 aa  219  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  54.74 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  53.85 
 
 		 96 aa  103  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 92 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  53.26 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  53.26 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1786  histone family protein DNA-binding protein  47.42 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0401434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1992  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 99 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0074793  normal  0.250036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 98 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3941  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  50.53 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  48.91 
 
 		 93 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1380  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 98 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 109 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1773  integration host factor subunit beta  48 
 
 		 100 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976325  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  46.32 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3125  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  decreased coverage  0.00823154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1565  histone-like DNA-binding protein  47.57 
 
 		 103 aa  97.1  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4060  integration host factor subunit beta  48.96 
 
 		 98 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 92 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  50 
 
 		 94 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0848  histone-like DNA-binding protein  45.26 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  45.74 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  45.83 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0356  histone family protein DNA-binding protein  44.33 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  46.59 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  50.55 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1751  integration host factor, beta subunit  49.47 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  49.47 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  47.42 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  41.82 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2222  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000109165  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  42.34 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1724  histone-like DNA-binding protein  45.26 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.142965  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  47.73 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  46.32 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  42.73 
 
 		 142 aa  93.6  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  93.6  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  47.87 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  47.87 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  47.87 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  47.87 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0564  histone-like DNA-binding protein  47.37 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>