More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2470 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  100 
 
 		 103 aa  209  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  100 
 
 		 103 aa  209  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  93.81 
 
 		 109 aa  187  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  89 
 
 		 104 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  87.88 
 
 		 104 aa  180  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  93.55 
 
 		 113 aa  177  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  85 
 
 		 104 aa  175  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1565  histone-like DNA-binding protein  84.38 
 
 		 103 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3125  histone family protein DNA-binding protein  80.81 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  decreased coverage  0.00823154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2245  putative integration host factor beta-subunit (ihf-beta) protein  79.8 
 
 		 111 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0965  integration host factor, beta subunit  79 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  74.75 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  74.75 
 
 		 138 aa  146  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  74.75 
 
 		 142 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  143  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  70.71 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2256  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0928  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0924  integration host factor subunit beta  69.79 
 
 		 107 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  68.75 
 
 		 107 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  66.02 
 
 		 135 aa  141  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  68.75 
 
 		 107 aa  140  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  68.48 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  69.23 
 
 		 95 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  65.93 
 
 		 95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  65.93 
 
 		 95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  63.83 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  57.61 
 
 		 95 aa  123  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0501  integration host factor, beta subunit  64.52 
 
 		 114 aa  123  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525141  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  59.34 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  59.34 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  60.87 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0957  integration host factor, beta subunit  61.54 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00640345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1307  histone family protein DNA-binding protein  62.37 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.226884  hitchhiker  0.000000648768 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  57.14 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  59.34 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  58.24 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  57.14 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  57.14 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  57.14 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  56.52 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  54.17 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  58.89 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  55.43 
 
 		 94 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  55.43 
 
 		 94 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  51.58 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  54.35 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  54.35 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2563  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.160302 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1596  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.878202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1647  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 101 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0979657  normal  0.0681876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1539  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  54.95 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  57.14 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1380  integration host factor subunit beta  51.04 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2401  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000261968  unclonable  0.000000000047672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1925  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000515528  unclonable  0.0000000000266845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2053  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000159286  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1773  integration host factor subunit beta  51.04 
 
 		 100 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976325  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3941  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4060  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1955  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000468135  unclonable  0.00000320833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1751  integration host factor, beta subunit  51.04 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  51.04 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  52.69 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2067  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000478736  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2395  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000343473  unclonable  0.00000762549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2278  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000837765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2071  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2122  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000593472  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1754  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014676  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3012  integration host factor, beta subunit  51.58 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  54.35 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2312  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000159711  hitchhiker  0.000000300932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  54.95 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  53.26 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2297  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000102507  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1586  histone family protein DNA-binding protein  47.31 
 
 		 99 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123094  hitchhiker  0.000875712 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  56.52 
 
 		 110 aa  103  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 94 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  51.09 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>