More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1026 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  100 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  100 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0501  integration host factor, beta subunit  63.04 
 
 		 114 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525141  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  65.93 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  67.03 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  64.84 
 
 		 142 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  64.84 
 
 		 138 aa  130  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  64.84 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  61.46 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  64.84 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  64.84 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 		 137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  59.6 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 		 107 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1307  histone family protein DNA-binding protein  60.87 
 
 		 114 aa  126  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.226884  hitchhiker  0.000000648768 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2256  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 		 98 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0928  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0924  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  63.83 
 
 		 102 aa  123  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  60.42 
 
 		 113 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  62.64 
 
 		 96 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0957  integration host factor, beta subunit  61.29 
 
 		 94 aa  123  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00640345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  61.54 
 
 		 95 aa  123  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  62.64 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  61.54 
 
 		 98 aa  121  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  59.34 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  57.73 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  59.34 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  57.89 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  58.24 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  59.34 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  55.1 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  58.24 
 
 		 94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  60.64 
 
 		 94 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  60.64 
 
 		 94 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1596  integration host factor subunit beta  60 
 
 		 111 aa  117  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.878202  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2245  putative integration host factor beta-subunit (ihf-beta) protein  54.46 
 
 		 111 aa  116  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  58.89 
 
 		 103 aa  115  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  58.24 
 
 		 94 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0965  integration host factor, beta subunit  58.24 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1565  histone-like DNA-binding protein  54 
 
 		 103 aa  114  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1539  integration host factor subunit beta  58.89 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  59.34 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000516669  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1647  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 101 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0979657  normal  0.0681876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  57.89 
 
 		 95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  54.74 
 
 		 95 aa  113  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  57.14 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  54.64 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  58.24 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  58.24 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  59.34 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1586  histone family protein DNA-binding protein  52.17 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123094  hitchhiker  0.000875712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  57.14 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0262  integration host factor beta-subunit  53.85 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1751  integration host factor, beta subunit  57.45 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  57.45 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00916  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.335745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2731  integration host factor, beta subunit  54.95 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00160452  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1431  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0064808  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1773  integration host factor subunit beta  57.45 
 
 		 100 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976325  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2416  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000431379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2684  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193078  normal  0.358809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4060  integration host factor subunit beta  57.45 
 
 		 98 aa  110  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2208  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000105854  normal  0.266842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1018  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000522422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1009  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000570398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00923  hypothetical protein  54.95 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.294308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1073  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0306564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  58.24 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 94 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3941  integration host factor subunit beta  58.24 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3125  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  decreased coverage  0.00823154 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  56.04 
 
 		 93 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1047  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.788464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1095  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.939272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0988  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.165109  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1015  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.613855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1080  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0899853 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1931  integration host factor, beta subunit  53.85 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  53.19 
 
 		 94 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2071  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000261968  unclonable  0.000000000047672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>