More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0996 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  81.72 
 
 		 93 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  70.65 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  70.33 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  72.53 
 
 		 92 aa  133  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  65.93 
 
 		 94 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  59.78 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  57.14 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  52.75 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  54.95 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 110 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1773  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 100 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976325  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 113 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 98 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3941  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 98 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  53.26 
 
 		 98 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 98 aa  103  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4060  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 98 aa  103  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1751  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162553  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 98 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  50.54 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1380  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  53.26 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 92 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  52.17 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3125  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  decreased coverage  0.00823154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  51.09 
 
 		 93 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 91 aa  100  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 96 aa  100  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2563  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.160302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  52.75 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 100 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1565  histone-like DNA-binding protein  51.09 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 103 aa  98.6  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3085  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 91 aa  98.2  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000115471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 107 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2245  putative integration host factor beta-subunit (ihf-beta) protein  53.85 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0965  integration host factor, beta subunit  53.26 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 92 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  48.91 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0262  integration host factor beta-subunit  50 
 
 		 112 aa  95.9  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 94 aa  95.9  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  50.55 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  46.74 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1596  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 111 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.878202  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1931  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  48.39 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1539  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  50 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  45.65 
 
 		 96 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 107 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  45.65 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>