More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3240 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 168 aa  339  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  62.26 
 
 		 106 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  60 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  57.61 
 
 		 92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2060  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 93 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1850  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 93 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1012  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000010655  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0558  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 93 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 91 aa  104  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  56.04 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  53.85 
 
 		 96 aa  101  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 93 aa  101  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0397  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 93 aa  101  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1781  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  99.4  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.88683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1299  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 93 aa  99  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184081  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  54.44 
 
 		 110 aa  99  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  49.51 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 91 aa  98.2  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1783  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1890  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  96.3  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.469333  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  50.52 
 
 		 101 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  50.5 
 
 		 95 aa  95.5  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  94.7  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 101 aa  94.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  51.61 
 
 		 110 aa  94  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  51.43 
 
 		 100 aa  94  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  50.53 
 
 		 101 aa  94  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 94 aa  94  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  53.26 
 
 		 94 aa  94  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 101 aa  94  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  50.53 
 
 		 101 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 104 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  48.39 
 
 		 102 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 98 aa  92  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  48.39 
 
 		 102 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  48.39 
 
 		 102 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  91.3  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  91.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 108 aa  91.7  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 95 aa  91.3  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 91 aa  91.3  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0698  histone-like DNA-binding protein  49.45 
 
 		 116 aa  90.9  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151806  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 94 aa  90.9  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0740  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  90.5  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0734  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 115 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0733  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 115 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.721245  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  51.02 
 
 		 135 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 113 aa  89.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  47.96 
 
 		 106 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0104  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  88.2  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  48.45 
 
 		 106 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  46.6 
 
 		 99 aa  87.8  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  46.6 
 
 		 99 aa  87.8  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  40.31 
 
 		 138 aa  87.8  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  45.71 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0424  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 102 aa  87.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149855  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  47.87 
 
 		 96 aa  87.4  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0356  histone family protein DNA-binding protein  38.95 
 
 		 102 aa  87  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  46.6 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 103 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 142 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 90 aa  86.3  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  46.39 
 
 		 103 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 97 aa  85.9  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  47.17 
 
 		 107 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  43.93 
 
 		 109 aa  85.1  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  51.06 
 
 		 94 aa  85.5  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  47.37 
 
 		 95 aa  84.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  85.1  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 137 aa  84.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1786  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 103 aa  84.7  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0401434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 95 aa  84.3  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  84.3  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  46.23 
 
 		 107 aa  84  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>