More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1720 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  100 
 
 		 113 aa  224  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  61.76 
 
 		 103 aa  130  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  69.89 
 
 		 98 aa  130  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  68.13 
 
 		 110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  66.3 
 
 		 94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  64.52 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  64.52 
 
 		 99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  64.52 
 
 		 99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  63.83 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  62.77 
 
 		 94 aa  123  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  62.77 
 
 		 94 aa  123  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  62.77 
 
 		 94 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  61.7 
 
 		 96 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 		 101 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  64.84 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 		 95 aa  120  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  59.41 
 
 		 101 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 101 aa  120  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  60.64 
 
 		 97 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 95 aa  120  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 103 aa  120  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  58.42 
 
 		 101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  61.96 
 
 		 93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0104  integration host factor subunit beta  63.04 
 
 		 94 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  61.96 
 
 		 93 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  60.44 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  61.54 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  56.99 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  62.37 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  58.7 
 
 		 93 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  59.34 
 
 		 95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2409  histone family protein DNA-binding protein  56.52 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  54.84 
 
 		 102 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  56.04 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  56.04 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  55.43 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  56.04 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  57.78 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  57.78 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  55.91 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  55.91 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  53.26 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  51.61 
 
 		 100 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  48.91 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  47.75 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  48.42 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  54.35 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  52.29 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  47.75 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  47.75 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  53.26 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  49.46 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2256  integration host factor subunit beta  47.79 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5428  integration host factor, beta subunit  56.32 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  49.5 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000516669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0928  integration host factor subunit beta  49.12 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0924  integration host factor subunit beta  49.12 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324388  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 92 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0501  integration host factor, beta subunit  49.53 
 
 		 114 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525141  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 98 aa  100  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 107 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  52.69 
 
 		 95 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0957  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00640345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2222  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  98.2  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000109165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2338  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  98.2  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  48.91 
 
 		 95 aa  97.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2563  histone-like DNA-binding protein  48.28 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.160302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  49.49 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 92 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  48.35 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  48.57 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  47.31 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1754  integration host factor subunit beta  48.91 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014676  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>