More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2142 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  83.33 
 
 		 91 aa  154  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2060  histone family protein DNA-binding protein  82.22 
 
 		 91 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  75.82 
 
 		 92 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  75.56 
 
 		 93 aa  145  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  71.11 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1850  histone family protein DNA-binding protein  69.66 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1781  histone family protein DNA-binding protein  68.13 
 
 		 91 aa  130  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.88683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  68.13 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1012  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000010655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1783  histone family protein DNA-binding protein  58.62 
 
 		 91 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 106 aa  110  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  54.95 
 
 		 91 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0397  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  57.47 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  56.67 
 
 		 91 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0558  histone family protein DNA-binding protein  56.32 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1890  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.469333  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  52.17 
 
 		 101 aa  103  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1299  histone family protein DNA-binding protein  54.02 
 
 		 93 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184081  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 93 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0740  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0733  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.721245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0734  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0698  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 93 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 93 aa  100  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 94 aa  98.6  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 94 aa  98.6  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  51.65 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 94 aa  98.6  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  50.55 
 
 		 96 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  52.22 
 
 		 94 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  46.74 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  48.91 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  46.74 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 96 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 101 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  52.17 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  47.78 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 99 aa  93.6  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 93 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 99 aa  93.6  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  45.65 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  47.83 
 
 		 100 aa  93.6  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  45.65 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  44.44 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  48.89 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  53.33 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 96 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2122  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000593472  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1955  integration host factor subunit beta  53.33 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000468135  unclonable  0.00000320833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  45.65 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  53.26 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  53.26 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 103 aa  91.7  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  44.57 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  53.33 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000261968  unclonable  0.000000000047672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2401  integration host factor subunit beta  53.33 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  47.78 
 
 		 110 aa  91.3  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1925  integration host factor subunit beta  53.33 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000515528  unclonable  0.0000000000266845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2053  integration host factor subunit beta  53.33 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000159286  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>