More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2127 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  184  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2910  histone family protein DNA-binding protein  60.44 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.351014  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  59.34 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1244  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.50556  normal  0.20479 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2563  histone-like DNA-binding protein  58.89 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.160302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  51.09 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  52.75 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2761  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.680423  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  55.43 
 
 		 98 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2063  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0888639  normal  0.0279949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  53.26 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  54.35 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 94 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 99 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  53.85 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 99 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  56.04 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  53.85 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  46.74 
 
 		 93 aa  98.2  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 95 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  48.35 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 100 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0501  integration host factor, beta subunit  48.91 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525141  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  45.65 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  45.65 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  51.65 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2409  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 94 aa  94  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000516669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  47.78 
 
 		 92 aa  93.6  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 		 91 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  51.14 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 95 aa  93.6  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  51.65 
 
 		 95 aa  93.6  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0957  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00640345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  50.55 
 
 		 93 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5428  integration host factor, beta subunit  51.72 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 95 aa  92.8  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1307  histone family protein DNA-binding protein  48.91 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.226884  hitchhiker  0.000000648768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 102 aa  92  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  51.65 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  48.91 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  45.56 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  90.5  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 96 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 113 aa  90.1  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  90.1  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2122  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  90.1  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000593472  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3125  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 112 aa  90.1  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  decreased coverage  0.00823154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0397  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02474  DNA-binding protein HU  45.56 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2278  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000837765  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1955  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000468135  unclonable  0.00000320833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>