More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0059 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  100 
 
 		 99 aa  203  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  100 
 
 		 99 aa  203  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  97.87 
 
 		 103 aa  189  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  96.81 
 
 		 103 aa  189  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  86.81 
 
 		 94 aa  164  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  86.81 
 
 		 94 aa  164  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  86.81 
 
 		 94 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  82.47 
 
 		 94 aa  163  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  76.53 
 
 		 101 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  78.02 
 
 		 92 aa  150  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  75.26 
 
 		 104 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  79.12 
 
 		 101 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  74.49 
 
 		 101 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  74.49 
 
 		 101 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  72.82 
 
 		 103 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  76.04 
 
 		 96 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  78.02 
 
 		 101 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  76.29 
 
 		 97 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  73.63 
 
 		 101 aa  141  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  74.73 
 
 		 110 aa  140  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  71.28 
 
 		 94 aa  140  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  68.69 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  65.66 
 
 		 100 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  68.69 
 
 		 102 aa  137  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  71.43 
 
 		 95 aa  137  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  68.69 
 
 		 102 aa  137  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  73.63 
 
 		 106 aa  137  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  71.43 
 
 		 95 aa  136  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  71.43 
 
 		 95 aa  135  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  71.43 
 
 		 103 aa  135  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  72.53 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  70.33 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  69.23 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  64.29 
 
 		 98 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  69.23 
 
 		 93 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  69.23 
 
 		 93 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  63.83 
 
 		 113 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0104  integration host factor subunit beta  61.86 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 102 aa  117  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5428  integration host factor, beta subunit  60.44 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2409  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  61.54 
 
 		 92 aa  110  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  54.95 
 
 		 96 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  56.12 
 
 		 98 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  53.76 
 
 		 95 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  53.85 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  53.85 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  56.04 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  53.68 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  51.92 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 137 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  53.12 
 
 		 96 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  50.96 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  56.04 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2256  integration host factor subunit beta  50.96 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  50.96 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  50.96 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  50.96 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  49.45 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  51.92 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  51.58 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0965  integration host factor, beta subunit  49.49 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  52.08 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  56.04 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  56.04 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0928  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 107 aa  103  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0924  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 107 aa  103  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324388  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  54.55 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 98 aa  103  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0501  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3026  hypothetical protein  49.47 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2884  hypothetical protein  49.47 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  52.58 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2245  putative integration host factor beta-subunit (ihf-beta) protein  50.53 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  52.58 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  51.49 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  52.58 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  52.58 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  52.58 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  52.58 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  52.58 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  52.58 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  50.54 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  50.54 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1539  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000516669  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1596  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.878202  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 92 aa  100  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  45.74 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>