More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1012 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1012  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  184  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000010655  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 91 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  66.67 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  61.11 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1783  histone family protein DNA-binding protein  63.33 
 
 		 91 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0397  histone family protein DNA-binding protein  63.33 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1299  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184081  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0558  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  65.88 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2060  histone family protein DNA-binding protein  64.71 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  58.89 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  56.04 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 168 aa  110  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  53.85 
 
 		 91 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  58.82 
 
 		 93 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1850  histone family protein DNA-binding protein  57.65 
 
 		 93 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1781  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.88683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0740  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0698  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151806  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0733  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.721245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0734  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  53.26 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  48.91 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  48.91 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  48.91 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0390  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000165854  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  44.57 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  48.35 
 
 		 92 aa  90.5  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  45.65 
 
 		 101 aa  89.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  46.74 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  47.25 
 
 		 95 aa  88.6  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  41.57 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  45.56 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  42.22 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  46.74 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  43.48 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  43.33 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  45.65 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  42.39 
 
 		 104 aa  87.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1890  histone family protein DNA-binding protein  52.94 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.469333  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  46.74 
 
 		 108 aa  87  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  39.33 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  39.33 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  39.33 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  39.33 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  39.33 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  39.33 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  39.33 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  39.33 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  39.33 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  43.48 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  46.74 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3125  histone family protein DNA-binding protein  39.56 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  decreased coverage  0.00823154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  45.65 
 
 		 93 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  46.74 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01420  nucleoid DNA-binding protein  41.11 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  41.76 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1468  DNA-binding protein HU beta subunit  42.86 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.961834  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>