More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1941 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1299  histone family protein DNA-binding protein  73.63 
 
 		 93 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184081  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0558  histone family protein DNA-binding protein  72.22 
 
 		 91 aa  141  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  68.89 
 
 		 91 aa  135  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1783  histone family protein DNA-binding protein  67.78 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  66.67 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  68.13 
 
 		 91 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0397  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1012  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000010655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 91 aa  117  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2060  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 91 aa  114  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  57.78 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  55.56 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  54.95 
 
 		 92 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1850  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 93 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1781  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.88683  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0733  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.721245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0734  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0698  histone-like DNA-binding protein  48.35 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0740  histone family protein DNA-binding protein  48.35 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  43.82 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1890  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.469333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  91.3  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  46.15 
 
 		 95 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  44.44 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  45.65 
 
 		 96 aa  90.5  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  47.25 
 
 		 101 aa  90.5  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3021  histone family protein DNA-binding protein  41.11 
 
 		 91 aa  90.1  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  48.91 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  40.66 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  48.91 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  48.91 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  48.91 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  50.55 
 
 		 94 aa  90.1  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000516669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  48.91 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  46.15 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  46.74 
 
 		 93 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  48.91 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  46.74 
 
 		 93 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  42.7 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  38.46 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3125  histone family protein DNA-binding protein  42.39 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  decreased coverage  0.00823154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 100 aa  87.8  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1647  integration host factor subunit beta  48.35 
 
 		 101 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0979657  normal  0.0681876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  42.22 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  43.96 
 
 		 93 aa  87  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 95 aa  87  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  41.86 
 
 		 90 aa  87  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000000481156  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  45.65 
 
 		 113 aa  87  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  48.91 
 
 		 94 aa  87  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  48.35 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  45.05 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  45.05 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  47.87 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  47.25 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  42.86 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  40.66 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>