More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1850 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1850  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 93 aa  186  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1781  histone family protein DNA-binding protein  73.33 
 
 		 91 aa  143  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.88683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  74.19 
 
 		 92 aa  141  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  68.82 
 
 		 93 aa  140  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2060  histone family protein DNA-binding protein  71.91 
 
 		 91 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  71.91 
 
 		 91 aa  137  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  69.66 
 
 		 91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  67.42 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 106 aa  110  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  64.04 
 
 		 96 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0558  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235916 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1012  histone family protein DNA-binding protein  57.65 
 
 		 91 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000010655  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  58.43 
 
 		 91 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1299  histone family protein DNA-binding protein  55.17 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184081  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  104  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  54.95 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1890  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.469333  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0397  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0740  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0698  histone-like DNA-binding protein  52.81 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151806  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0733  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 115 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.721245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0734  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 115 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 95 aa  97.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  50 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1783  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  48.89 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 93 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 93 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  46.81 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  44.94 
 
 		 90 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000237544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000145695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000148823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000587043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000112809  hitchhiker  0.00000484208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000818253  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  48.89 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000668206  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  46.07 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  48.39 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  48.89 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 93 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 92 aa  88.2  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 93 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  45.56 
 
 		 93 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  42.55 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  42.55 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  46.07 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  45.05 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  43.01 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  46.07 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  49.47 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  42.7 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  43.82 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  47.83 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  46.67 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 91 aa  84.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2053  nucleoid protein HU beta subunit  42.7 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000457213  normal  0.0670315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3493  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.175993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41210  DNA-binding protein HU  42.7 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0758892  normal  0.416187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  84.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23600  histone-like DNA-binding protein  42.7 
 
 		 90 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  46.24 
 
 		 94 aa  84  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  42.39 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  44.44 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  48.89 
 
 		 98 aa  83.6  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  40.22 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2873  transcriptional regulator HU subunit beta  41.57 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  41.57 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  42.55 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0822  DNA-binding protein HU-beta  41.38 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  50.54 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  50.54 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  47.78 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2312  integration host factor subunit beta  46.67 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000159711  hitchhiker  0.000000300932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>