More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3890 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3890  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00577946  normal  0.782973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3240  histone family protein DNA-binding protein  68.54 
 
 		 168 aa  130  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0908312  normal  0.935864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1833  histone-like DNA-binding protein  59.34 
 
 		 93 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1746  integration host factor, beta subunit  58.43 
 
 		 92 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2156  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1850  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 93 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1425  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 96 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.589972  normal  0.158617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2142  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0158969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2060  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1455  BHL, histone-like protein  56.18 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000108393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1941  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1468  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 93 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0558  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235916 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  51.06 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  53.61 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  52.08 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3254  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00043696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0996  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1299  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 93 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184081  normal  0.0709018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1781  histone family protein DNA-binding protein  49.43 
 
 		 91 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.88683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1870  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1799  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000246385  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1783  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.464491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  55.56 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0397  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 		 91 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2127  histone family protein DNA-binding protein  48.89 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.053559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3207  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1012  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  96.7  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000010655  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3213  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1890  histone family protein DNA-binding protein  53.41 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.469333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4105  nucleoid protein Hbs  46.67 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1880  nucleoid DNA-binding protein  52.17 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0356  histone family protein DNA-binding protein  46.94 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  50.55 
 
 		 98 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1786  histone family protein DNA-binding protein  45.19 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0401434 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  48.45 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  52.81 
 
 		 101 aa  91.3  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0424  histone family protein DNA-binding protein  46.88 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149855  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  48.91 
 
 		 113 aa  90.9  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1992  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 99 aa  90.1  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0074793  normal  0.250036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 100 aa  90.5  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  51.61 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  44.32 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1351  histone family protein DNA-binding protein  46.67 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0471037  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  49.47 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  49.47 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  44.32 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 94 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1426  histone family protein DNA-binding protein  44.66 
 
 		 102 aa  88.6  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0564  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0848  histone-like DNA-binding protein  47.67 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0698  histone-like DNA-binding protein  47.73 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 94 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000516669  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  47.96 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0740  histone family protein DNA-binding protein  47.73 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0734  histone family protein DNA-binding protein  47.73 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  48.31 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0461  histone family protein DNA-binding protein  44.12 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.376006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0733  histone family protein DNA-binding protein  47.73 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.721245  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  43.43 
 
 		 101 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  49.45 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 94 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1724  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 102 aa  87.8  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.142965  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  48.31 
 
 		 94 aa  87.8  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  43.43 
 
 		 101 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  47.19 
 
 		 93 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  51.11 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  43.43 
 
 		 101 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  46.15 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  48.54 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  44.44 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  53.26 
 
 		 95 aa  87.4  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  53.26 
 
 		 95 aa  87.4  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  48.54 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  48.54 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  48.54 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  43.43 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2416  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000431379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1431  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0064808  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  44.33 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0104  integration host factor subunit beta  52.81 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  46.15 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1018  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000522422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>