More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0180 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  183  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  89.01 
 
 		 91 aa  167  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  76.67 
 
 		 97 aa  144  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  70 
 
 		 94 aa  137  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  71.11 
 
 		 93 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1872  histone family protein DNA-binding protein  67.78 
 
 		 94 aa  130  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  65.56 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  65.56 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3754  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  63.33 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  60 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  62.22 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  61.54 
 
 		 100 aa  117  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 92 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  57.78 
 
 		 99 aa  115  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  57.78 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  57.78 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  57.78 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  52.75 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  52.75 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  50 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2066  histone family protein DNA-binding protein  52.75 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151573  normal  0.0307136 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3685  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 		 93 aa  103  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0002  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3057  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 97 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  48.89 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6231  integration host factor, alpha subunit  50 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.75949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  47.78 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7074  integration host factor, alpha subunit  50 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3967  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0228483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1314  integration host factor, alpha subunit  43.82 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  41.11 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2055  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2330  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.45414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2016  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  43.82 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3032  integration host factor subunit alpha  43.96 
 
 		 100 aa  90.1  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814183  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1661  integration host factor, alpha subunit  47.78 
 
 		 97 aa  90.1  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  43.18 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  43.82 
 
 		 101 aa  90.1  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  46.51 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1031  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2924  integration host factor, alpha subunit  45.56 
 
 		 105 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242436  hitchhiker  0.000500218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0762  integration host factor subunit alpha  45.35 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0699  integration host factor, alpha subunit  42.7 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101642  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1405  integration host factor, alpha subunit  45.05 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1805  integration host factor, alpha subunit  45.35 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  45.35 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1951  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 98 aa  88.6  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0689999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0651  integration host factor, alpha subunit  45.56 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  44.44 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  44.44 
 
 		 118 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3294  integration host factor, alpha subunit  45.56 
 
 		 105 aa  87.4  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.13347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3378  integration host factor, alpha subunit  44.44 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  44.44 
 
 		 123 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  43.02 
 
 		 98 aa  87.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2417  integration host factor subunit alpha  45.35 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508912  hitchhiker  0.0000292071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1830  integration host factor subunit alpha  45.35 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00321456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1875  integration host factor subunit alpha  45.35 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00111351  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3557  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1902  integration host factor subunit alpha  45.35 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352289  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2055  integration host factor subunit alpha  42.7 
 
 		 100 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1909  integration host factor subunit alpha  45.35 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000003309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0969  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1458  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1090  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0197  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.878199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1718  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02444  integration host factor subunit alpha  43.02 
 
 		 99 aa  87  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0239469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1897  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4621  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2589  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1405  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1533  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.612274  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0999  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1365  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1741  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2596  integration host factor subunit alpha  45.35 
 
 		 98 aa  87.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1773  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.330159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2468  integration host factor subunit alpha  45.35 
 
 		 98 aa  87.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0406236  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1481  integration host factor subunit alpha  41.57 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  45.56 
 
 		 105 aa  86.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  43.68 
 
 		 100 aa  86.7  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  42.53 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1552  integration host factor, alpha subunit  40.45 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2750  integration host factor subunit alpha  40.45 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2510  integration host factor subunit alpha  44.19 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  42.53 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  44.19 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  42.53 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  43.02 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1377  integration host factor subunit alpha  40.45 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377563  normal  0.528891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1604  integration host factor subunit alpha  44.19 
 
 		 99 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316087  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0913  integration host factor subunit alpha  42.7 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28720  integration host factor subunit alpha  44.19 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000206678  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1863  integration host factor subunit alpha  43.82 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00832208  normal  0.529294 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1930  integration host factor, alpha subunit  43.02 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000106762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0846  integration host factor subunit alpha  43.02 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000670658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>