More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3754 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3754  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 101 aa  203  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  62.89 
 
 		 97 aa  133  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  67.78 
 
 		 91 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1872  histone family protein DNA-binding protein  67.78 
 
 		 94 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  65.56 
 
 		 93 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  64.44 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  60.44 
 
 		 91 aa  123  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  62.22 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  59.34 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  60 
 
 		 93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  60.44 
 
 		 91 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  56.12 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  56.12 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  60 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 92 aa  114  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  60 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  60.87 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3057  histone-like DNA-binding protein  59.34 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  54.44 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  54.44 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  50.55 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2066  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151573  normal  0.0307136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  51.65 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  48.31 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  48.96 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1661  integration host factor, alpha subunit  52.17 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  46.15 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1327  integration host factor, alpha subunit  48.35 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125041  hitchhiker  0.0021642 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3685  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 		 93 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0913  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1863  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 102 aa  94.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00832208  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  48.31 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  48.31 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  45.05 
 
 		 98 aa  94.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  48.31 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  45.65 
 
 		 98 aa  94  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2924  integration host factor, alpha subunit  46.67 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242436  hitchhiker  0.000500218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3056  histone-like DNA-binding protein  64.18 
 
 		 70 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216712  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1951  integration host factor subunit alpha  46.15 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0689999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  46.67 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1533  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.612274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0651  integration host factor, alpha subunit  46.67 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2994  integration host factor, alpha subunit  42.11 
 
 		 97 aa  92  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1741  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7074  integration host factor, alpha subunit  47 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1090  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2055  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549761  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1773  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.330159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02444  integration host factor subunit alpha  45.05 
 
 		 99 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0239469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1897  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0197  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.878199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4621  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0969  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3967  histone family protein DNA-binding protein  47.83 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0228483 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1458  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6231  integration host factor, alpha subunit  51.11 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.75949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1721  integration host factor subunit alpha  44.94 
 
 		 101 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1552  integration host factor, alpha subunit  42.71 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1405  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1314  integration host factor, alpha subunit  45.65 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0999  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1365  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1718  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1481  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3378  integration host factor, alpha subunit  44.09 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  42.42 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1718  integration host factor subunit alpha  44.09 
 
 		 98 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000312537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2596  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 98 aa  92  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2468  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 98 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0406236  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2589  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 134 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  42.27 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1826  integration host factor subunit alpha  44.09 
 
 		 98 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2619  integration host factor subunit alpha  44.09 
 
 		 98 aa  92  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1710  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  92  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.707381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2750  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1409  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0010312  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2799  integration host factor subunit alpha  39.78 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  44.09 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1377  integration host factor subunit alpha  46.51 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377563  normal  0.528891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1604  integration host factor subunit alpha  45.74 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316087  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1472  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0002  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1405  integration host factor, alpha subunit  45.83 
 
 		 100 aa  91.3  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  44.09 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2237  integration host factor, alpha subunit  43.3 
 
 		 99 aa  90.9  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0376768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2608  integration host factor, alpha subunit  43.3 
 
 		 99 aa  90.9  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0762  integration host factor subunit alpha  43.01 
 
 		 101 aa  90.9  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2068  integration host factor subunit alpha  44.94 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0298794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1810  integration host factor subunit alpha  43.96 
 
 		 98 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2167  integration host factor subunit alpha  43.96 
 
 		 98 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0460926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1865  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 98 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3557  integration host factor subunit alpha  49.45 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2087  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 98 aa  90.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1830  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00321456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2510  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1909  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000003309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28720  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000206678  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>