More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1918 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 92 aa  184  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 91 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 91 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3754  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  56.52 
 
 		 97 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  55.43 
 
 		 93 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1872  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  55.43 
 
 		 94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  55.56 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 92 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  54.35 
 
 		 92 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3685  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  55.56 
 
 		 91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  57.78 
 
 		 99 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  56.52 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  56.52 
 
 		 113 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  56.67 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  59.34 
 
 		 100 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  53.26 
 
 		 93 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3032  integration host factor subunit alpha  51.65 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814183  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  53.33 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  50.55 
 
 		 96 aa  100  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  50.55 
 
 		 96 aa  100  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2677  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 108 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00137939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1721  integration host factor subunit alpha  48.31 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  48.89 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0913  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2924  integration host factor, alpha subunit  48.89 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242436  hitchhiker  0.000500218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2799  integration host factor subunit alpha  49.44 
 
 		 99 aa  97.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1408  integration host factor subunit alpha  48.89 
 
 		 106 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.422535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 100 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4630  integration host factor subunit alpha  48.89 
 
 		 119 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00633863  normal  0.0311538 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 100 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 100 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1587  integration host factor subunit alpha  48.89 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1863  integration host factor subunit alpha  48.31 
 
 		 102 aa  97.1  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00832208  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2237  integration host factor, alpha subunit  53.33 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0376768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2608  integration host factor, alpha subunit  53.33 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0002  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1281  integration host factor subunit alpha  52.33 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3056  histone-like DNA-binding protein  68.12 
 
 		 70 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216712  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  50 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  46.07 
 
 		 100 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1166  integration host factor subunit alpha  50.56 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  46.67 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  49.44 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3057  histone-like DNA-binding protein  52.22 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1773  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.330159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02444  integration host factor subunit alpha  51.69 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0239469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4610  integration host factor subunit alpha  51.69 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428618  normal  0.0608017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1458  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2853  integration host factor subunit alpha  50.56 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.769617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1583  integration host factor subunit alpha  52.33 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0969  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1641  integration host factor subunit alpha  52.33 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860546  normal  0.370826 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1718  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1741  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1090  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1971  integration host factor subunit alpha  52.33 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1897  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1405  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4621  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0197  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.878199  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0999  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1365  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1533  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.612274  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1481  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2589  integration host factor subunit alpha  53.49 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1342  integration host factor, alpha subunit  50.56 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2108  integration host factor subunit alpha  49.44 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283165  normal  0.12287 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0846  integration host factor subunit alpha  50.56 
 
 		 98 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000670658  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2394  integration host factor subunit alpha  50.56 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  48.31 
 
 		 99 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1454  integration host factor subunit alpha  50.56 
 
 		 116 aa  94  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2068  integration host factor subunit alpha  50.56 
 
 		 97 aa  93.6  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0298794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2214  integration host factor subunit alpha  50.56 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.600475  normal  0.239128 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2066  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151573  normal  0.0307136 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1314  integration host factor, alpha subunit  47.19 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1876  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1710  integration host factor subunit alpha  50.56 
 
 		 99 aa  93.6  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.707381  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  43.33 
 
 		 101 aa  93.6  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2093  integration host factor subunit alpha  46.67 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1552  integration host factor, alpha subunit  52.33 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2750  integration host factor subunit alpha  52.33 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1377  integration host factor subunit alpha  52.33 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377563  normal  0.528891 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2014  integration host factor subunit alpha  46.67 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0886978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3095  integration host factor subunit alpha  48.31 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0706803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1751  integration host factor, alpha subunit  52.17 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0308436 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1604  integration host factor subunit alpha  49.44 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2055  integration host factor subunit alpha  48.31 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549761  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2468  integration host factor subunit alpha  49.44 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0406236  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1718  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 98 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000312537  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1826  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 98 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1951  integration host factor subunit alpha  50.53 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0689999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2596  integration host factor subunit alpha  49.44 
 
 		 98 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>