More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3032 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3032  integration host factor subunit alpha  100 
 
 
100 aa  199  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814183  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0771  integration host factor subunit alpha  61.7 
 
 
128 aa  115  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.801748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2518  integration host factor subunit alpha  61.7 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0778  integration host factor subunit alpha  61.7 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1198  integration host factor subunit alpha  58.76 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  57.58 
 
 
105 aa  114  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  59 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  59 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  59 
 
 
100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1147  integration host factor subunit alpha  58.76 
 
 
111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.205645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1287  integration host factor subunit alpha  58.51 
 
 
112 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.921659  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  59.57 
 
 
100 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  55.56 
 
 
101 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0830  integration host factor subunit alpha  55.67 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120813  normal  0.0891496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  57.89 
 
 
105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1863  integration host factor subunit alpha  57.45 
 
 
102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00832208  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1721  integration host factor subunit alpha  57.45 
 
 
101 aa  110  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0913  integration host factor subunit alpha  57.45 
 
 
100 aa  110  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7074  integration host factor, alpha subunit  58.95 
 
 
105 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2016  histone family protein DNA-binding protein  57.89 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6231  integration host factor, alpha subunit  58.95 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.75949  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2055  histone family protein DNA-binding protein  57.89 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2330  histone family protein DNA-binding protein  57.89 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1631  integration host factor subunit alpha  54.64 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2677  integration host factor subunit alpha  54.84 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00137939  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1417  integration host factor, alpha subunit  52.13 
 
 
97 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.097817  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2924  integration host factor, alpha subunit  58.06 
 
 
105 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242436  hitchhiker  0.000500218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1408  integration host factor subunit alpha  54.84 
 
 
106 aa  107  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.422535  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  53.68 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1587  integration host factor subunit alpha  54.84 
 
 
110 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3967  histone family protein DNA-binding protein  55.79 
 
 
106 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0228483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  54.84 
 
 
123 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  54.84 
 
 
123 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  51.65 
 
 
92 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4630  integration host factor subunit alpha  53.76 
 
 
119 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00633863  normal  0.0311538 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
113 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
113 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 
113 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3557  integration host factor subunit alpha  57.78 
 
 
100 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  50 
 
 
99 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2365  integration host factor subunit alpha  54.84 
 
 
98 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  47.83 
 
 
96 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  47.83 
 
 
96 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0639  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 
103 aa  100  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1166  integration host factor subunit alpha  51.58 
 
 
136 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1583  integration host factor subunit alpha  53.85 
 
 
104 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1641  integration host factor subunit alpha  53.85 
 
 
138 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860546  normal  0.370826 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  51.09 
 
 
104 aa  100  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1971  integration host factor subunit alpha  53.85 
 
 
138 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3294  integration host factor, alpha subunit  52.17 
 
 
105 aa  99.4  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.13347 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  44.21 
 
 
96 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1281  integration host factor subunit alpha  50.53 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0651  integration host factor, alpha subunit  52.13 
 
 
112 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1458  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4621  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15527  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0999  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1365  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
131 aa  97.1  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1773  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
136 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.330159 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1481  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1405  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
131 aa  97.1  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1741  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1718  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1897  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0969  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
134 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1090  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
134 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1533  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
134 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.612274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0197  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
134 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.878199  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3378  integration host factor, alpha subunit  51.65 
 
 
125 aa  97.1  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2589  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
134 aa  96.7  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4986  histone family protein DNA-binding protein  51.58 
 
 
105 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  47.31 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1013  integration host factor subunit alpha  52.13 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00925023 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2066  histone family protein DNA-binding protein  44.57 
 
 
96 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151573  normal  0.0307136 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2750  integration host factor subunit alpha  50 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  47.42 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1377  integration host factor subunit alpha  50 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377563  normal  0.528891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  52.13 
 
 
99 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1552  integration host factor, alpha subunit  50.55 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54168  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  44.44 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1997  integration host factor subunit alpha  47.92 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000120885  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1070  DNA-binding protein, HU family  51.69 
 
 
91 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  49.47 
 
 
101 aa  94.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2186  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
98 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  46.67 
 
 
93 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2510  integration host factor subunit alpha  50 
 
 
100 aa  94  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28720  integration host factor subunit alpha  50 
 
 
100 aa  94  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000206678  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3475  integration host factor subunit alpha  50 
 
 
100 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981005  hitchhiker  0.00278356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2471  integration host factor subunit alpha  50 
 
 
100 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1894  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
98 aa  94  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.585308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1792  integration host factor subunit alpha  49.46 
 
 
99 aa  94  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704445  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3219  integration host factor subunit alpha  50 
 
 
100 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2150  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
98 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.872084  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1957  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
99 aa  94  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.126843  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  49.47 
 
 
99 aa  94  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2047  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
99 aa  94  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240665  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1973  integration host factor subunit alpha  50 
 
 
100 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0364622 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1826  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
98 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3019  integration host factor subunit alpha  50 
 
 
101 aa  93.6  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.616425  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1718  integration host factor subunit alpha  51.09 
 
 
98 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000312537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>