More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0092 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  100 
 
 		 96 aa  194  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  85.11 
 
 		 96 aa  169  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  85.11 
 
 		 96 aa  169  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2066  histone family protein DNA-binding protein  82.98 
 
 		 96 aa  165  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151573  normal  0.0307136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  61.54 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  61.96 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  63.33 
 
 		 99 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  62.22 
 
 		 113 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  62.22 
 
 		 113 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  61.7 
 
 		 100 aa  121  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  59.34 
 
 		 91 aa  120  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 97 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1997  integration host factor subunit alpha  58.51 
 
 		 100 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000120885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  57.78 
 
 		 93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 93 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  56.04 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  55.21 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0762  integration host factor subunit alpha  56.25 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1773  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.330159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4621  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1458  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0999  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1481  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1718  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1741  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1090  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1013  integration host factor subunit alpha  58.51 
 
 		 103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00925023 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1897  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0969  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1533  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.612274  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1377  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377563  normal  0.528891 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1405  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1552  integration host factor, alpha subunit  56.99 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1365  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0197  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.878199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  57.29 
 
 		 99 aa  114  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2750  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2589  integration host factor subunit alpha  56.99 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2150  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.872084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2671  integration host factor subunit alpha  58.24 
 
 		 100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.998853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1792  integration host factor subunit alpha  55.32 
 
 		 99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704445  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2186  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3019  integration host factor subunit alpha  59.77 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.616425  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1718  integration host factor subunit alpha  53.19 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000312537  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1826  integration host factor subunit alpha  53.19 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2047  integration host factor subunit alpha  53.19 
 
 		 99 aa  111  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2619  integration host factor subunit alpha  53.19 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1957  integration host factor subunit alpha  53.19 
 
 		 99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.126843  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1730  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.976876  normal  0.494462 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  54.84 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1894  integration host factor subunit alpha  53.19 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.585308  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01681  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00950044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1930  integration host factor, alpha subunit  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000106762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2237  integration host factor, alpha subunit  57.61 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0376768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1954  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.57207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1834  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.155105  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01670  hypothetical protein  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00452626  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2430  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2608  integration host factor, alpha subunit  57.61 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2006  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.608113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1434  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1450  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1478  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1919  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.445655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1931  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000683366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  57.14 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1467  integration host factor subunit alpha  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0493  integration host factor subunit alpha  57.47 
 
 		 101 aa  110  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1166  integration host factor subunit alpha  54.74 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0846  integration host factor subunit alpha  53.76 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000670658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2994  integration host factor, alpha subunit  53.19 
 
 		 97 aa  110  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1583  integration host factor subunit alpha  58.14 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1281  integration host factor subunit alpha  54.74 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1641  integration host factor subunit alpha  58.14 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860546  normal  0.370826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1971  integration host factor subunit alpha  58.14 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  50.53 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  52.63 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1604  integration host factor subunit alpha  54.08 
 
 		 99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02444  integration host factor subunit alpha  51.61 
 
 		 99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0239469  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0699  integration host factor, alpha subunit  56.32 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101642  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1882  integration host factor alpha-subunit  58.14 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02112  integration host factor subunit alpha  52.08 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003703  integration host factor alpha subunit  52.63 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281505  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2214  integration host factor subunit alpha  53.06 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.600475  normal  0.239128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1710  integration host factor subunit alpha  53.06 
 
 		 99 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.707381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1314  integration host factor, alpha subunit  55.17 
 
 		 100 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1875  integration host factor subunit alpha  53.06 
 
 		 98 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00111351  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1830  integration host factor subunit alpha  53.06 
 
 		 98 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00321456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1909  integration host factor subunit alpha  53.06 
 
 		 98 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000003309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2417  integration host factor subunit alpha  53.06 
 
 		 98 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508912  hitchhiker  0.0000292071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1902  integration host factor subunit alpha  53.06 
 
 		 98 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  53.85 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2087  integration host factor subunit alpha  53.06 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  53.68 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1810  integration host factor subunit alpha  53.06 
 
 		 98 aa  105  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2167  integration host factor subunit alpha  53.06 
 
 		 98 aa  105  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0460926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1865  integration host factor subunit alpha  53.06 
 
 		 98 aa  105  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>