More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3057 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3057  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  58.89 
 
 		 97 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3754  histone family protein DNA-binding protein  59.34 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 93 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  54.26 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  57.14 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  52.69 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  52.69 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  52.69 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  56.99 
 
 		 100 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  54.95 
 
 		 91 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  56.04 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1872  histone family protein DNA-binding protein  53.26 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  52.75 
 
 		 91 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  53.33 
 
 		 93 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  49.45 
 
 		 101 aa  97.4  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 94 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  45.16 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  50.56 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2471  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3475  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981005  hitchhiker  0.00278356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2384  integration host factor, alpha subunit  47.25 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2168  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1937  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0682795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3219  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  48.35 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  45.36 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1973  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  47.83 
 
 		 96 aa  95.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1982  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219997  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2510  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0762  integration host factor subunit alpha  48.35 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28720  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000206678  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02444  integration host factor subunit alpha  46.74 
 
 		 99 aa  94.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0239469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  46.15 
 
 		 99 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 98 aa  94.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2055  integration host factor subunit alpha  45.05 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549761  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1997  integration host factor subunit alpha  44.79 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000120885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0651  integration host factor, alpha subunit  46.67 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2994  integration host factor, alpha subunit  44.94 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1826  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1718  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000312537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2619  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2047  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1951  integration host factor subunit alpha  46.74 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0689999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1957  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.126843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1894  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.585308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2924  integration host factor, alpha subunit  45.56 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242436  hitchhiker  0.000500218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3056  histone-like DNA-binding protein  58.82 
 
 		 70 aa  90.5  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216712  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2150  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 98 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.872084  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01681  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00950044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1930  integration host factor, alpha subunit  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000106762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1792  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1931  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000683366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01670  hypothetical protein  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00452626  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2186  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1478  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  43.96 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2430  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1467  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2365  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2006  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.608113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1834  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.155105  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1919  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.445655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1434  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1954  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.57207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1730  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.976876  normal  0.494462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  47.78 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1450  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  47.78 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  43.82 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2799  integration host factor subunit alpha  43.75 
 
 		 99 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  44.94 
 
 		 100 aa  88.6  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1805  integration host factor, alpha subunit  46.07 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  43.82 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  43.48 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1810  integration host factor subunit alpha  45.65 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2167  integration host factor subunit alpha  45.65 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0460926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1710  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 99 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.707381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  43.82 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20480  integration host factor, alpha subunit  46.51 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2068  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 97 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0298794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02112  integration host factor subunit alpha  43.96 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1604  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1147  integration host factor subunit alpha  44.94 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.205645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1830  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00321456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2087  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1909  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000003309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2468  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0406236  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2596  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2417  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508912  hitchhiker  0.0000292071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1902  integration host factor subunit alpha  44.57 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352289  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003703  integration host factor alpha subunit  43.96 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>