More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1031 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1031  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 94 aa  188  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0002  histone family protein DNA-binding protein  53.26 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  47.78 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  48.91 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  46.67 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  44.57 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  44.57 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  47.83 
 
 		 99 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  44.57 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2967  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 97 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.160744  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2066  histone family protein DNA-binding protein  44.57 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151573  normal  0.0307136 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3754  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 		 101 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  88.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3685  histone family protein DNA-binding protein  48.91 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 93 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2608  integration host factor, alpha subunit  43.62 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2237  integration host factor, alpha subunit  43.62 
 
 		 99 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0376768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  45.56 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0517  histone-like DNA-binding protein  45.65 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492625  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3032  integration host factor subunit alpha  42.86 
 
 		 100 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814183  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1661  integration host factor, alpha subunit  43.48 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2538  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1405  integration host factor, alpha subunit  46.07 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1070  DNA-binding protein, HU family  43.33 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  38.71 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1560  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  41.11 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  40 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  41.11 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  41.11 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1417  integration host factor, alpha subunit  38.04 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.097817  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1872  histone family protein DNA-binding protein  41.3 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4610  integration host factor subunit alpha  40 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428618  normal  0.0608017 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  42.86 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2314  histone family protein DNA-binding protein  41.94 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800126  normal  0.266059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2848  integration host factor subunit alpha  37.63 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3557  integration host factor subunit alpha  44.44 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1876  histone family protein DNA-binding protein  38.71 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0699  integration host factor, alpha subunit  39.56 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101642  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1604  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2214  integration host factor subunit alpha  39.56 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.600475  normal  0.239128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1792  integration host factor subunit alpha  40.43 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704445  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1546  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  4.0402e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  40 
 
 		 100 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1997  integration host factor subunit alpha  40.66 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000120885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  38.89 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000047794  unclonable  0.0000440637 
 
 
 
NC_009074  BURPS668_1718  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2994  integration host factor, alpha subunit  40.66 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0197  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.878199  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1405  integration host factor subunit alpha  40.23 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  38.89 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1090  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1897  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1773  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.330159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4621  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2047  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240665  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1721  integration host factor subunit alpha  40.43 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2589  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1894  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.585308  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1957  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.126843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0969  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1533  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.612274  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1458  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0999  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1741  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1710  integration host factor subunit alpha  38.3 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.707381  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1365  integration host factor subunit alpha  40.23 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  34.44 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1481  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01681  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00950044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1930  integration host factor, alpha subunit  39.36 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000106762  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  40.86 
 
 		 105 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1434  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1730  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.976876  normal  0.494462 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  37.78 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000997119  hitchhiker  0.0000985943 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1450  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1834  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.155105  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1931  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000683366  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2394  integration host factor subunit alpha  36.96 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1478  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1919  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.445655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01670  hypothetical protein  39.36 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00452626  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2006  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.608113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1954  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.57207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  37.23 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1454  integration host factor subunit alpha  36.96 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2430  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1467  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1826  integration host factor subunit alpha  38.3 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>