More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1560 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1560  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 97 aa  197  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0517  histone-like DNA-binding protein  95.88 
 
 		 97 aa  188  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.492625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2538  histone family protein DNA-binding protein  97.87 
 
 		 95 aa  187  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0181  histone family protein DNA-binding protein  81.52 
 
 		 95 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2967  histone family protein DNA-binding protein  76.84 
 
 		 97 aa  154  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.160744  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2236  histone family protein DNA-binding protein  76.84 
 
 		 98 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0002  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1031  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3032  integration host factor subunit alpha  38.95 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814183  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  39.58 
 
 		 105 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2608  integration host factor, alpha subunit  43.33 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2237  integration host factor, alpha subunit  43.33 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0376768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1583  integration host factor subunit alpha  39.77 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1641  integration host factor subunit alpha  39.77 
 
 		 138 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860546  normal  0.370826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  40.22 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  40.22 
 
 		 113 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  42.86 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1971  integration host factor subunit alpha  39.77 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1166  integration host factor subunit alpha  37.78 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  40 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1281  integration host factor subunit alpha  37.5 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1458  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1405  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4621  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0493  integration host factor subunit alpha  43.18 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0999  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1773  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.330159 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1365  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1481  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1741  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1718  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1090  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1897  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3019  integration host factor subunit alpha  40.91 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.616425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0197  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.878199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  38.04 
 
 		 93 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2589  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0969  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2510  integration host factor subunit alpha  42.05 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1533  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.612274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28720  integration host factor subunit alpha  42.05 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000206678  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  42.22 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1377  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377563  normal  0.528891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2750  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1552  integration host factor, alpha subunit  38.64 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2016  histone family protein DNA-binding protein  35.79 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  37.78 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  38.89 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2671  integration host factor subunit alpha  38.89 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.998853 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1013  integration host factor subunit alpha  38.89 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00925023 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1721  integration host factor subunit alpha  41.38 
 
 		 101 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  38.04 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  39.13 
 
 		 92 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7074  integration host factor, alpha subunit  34.74 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6231  integration host factor, alpha subunit  34.74 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.75949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1982  integration host factor subunit alpha  40.91 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219997  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1417  integration host factor, alpha subunit  40.43 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.097817  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2471  integration host factor subunit alpha  39.77 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1973  integration host factor subunit alpha  39.77 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  37.21 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4986  histone family protein DNA-binding protein  33.68 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777024  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3475  integration host factor subunit alpha  39.77 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981005  hitchhiker  0.00278356 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1661  integration host factor, alpha subunit  39.56 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3219  integration host factor subunit alpha  39.77 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2384  integration host factor, alpha subunit  39.77 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2168  integration host factor subunit alpha  39.77 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  40.23 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1937  integration host factor subunit alpha  39.77 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0682795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1997  integration host factor subunit alpha  36.96 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000120885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  36.96 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  36.96 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2055  histone family protein DNA-binding protein  34.74 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2330  histone family protein DNA-binding protein  34.74 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.45414 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  39.08 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  35.16 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  34.78 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0913  integration host factor subunit alpha  36.46 
 
 		 100 aa  70.5  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  40.23 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  36.96 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1863  integration host factor subunit alpha  39.08 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00832208  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  37.36 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0065  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3247  histone-like DNA-binding protein  35.56 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2055  integration host factor subunit alpha  39.08 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549761  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0084  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0066  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3967  histone family protein DNA-binding protein  33.68 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0228483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3067  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0353619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0005  histone-like DNA-binding protein  35.56 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  37.36 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  38.04 
 
 		 94 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0055  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0065  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0004  DNA-binding protein HU-alpha  34.41 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2972  DNA-binding protein HU-alpha  34.44 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2937  histone family protein DNA-binding protein  31.46 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0762  integration host factor subunit alpha  38.64 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1629  DNA-binding protein HU, form B  34.44 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>