More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4986 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4986  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 105 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7074  integration host factor, alpha subunit  85.58 
 
 		 105 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6231  integration host factor, alpha subunit  84.62 
 
 		 104 aa  178  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.75949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2330  histone family protein DNA-binding protein  81.44 
 
 		 108 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.45414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2055  histone family protein DNA-binding protein  81.44 
 
 		 108 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3967  histone family protein DNA-binding protein  77.36 
 
 		 106 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0228483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2016  histone family protein DNA-binding protein  80.41 
 
 		 108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  72.92 
 
 		 105 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  65.66 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4630  integration host factor subunit alpha  68.09 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00633863  normal  0.0311538 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1587  integration host factor subunit alpha  66.32 
 
 		 110 aa  133  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2677  integration host factor subunit alpha  65.98 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00137939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  66.67 
 
 		 123 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  66.67 
 
 		 123 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1408  integration host factor subunit alpha  62.14 
 
 		 106 aa  130  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.422535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  64.95 
 
 		 105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0651  integration host factor, alpha subunit  63.37 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3378  integration host factor, alpha subunit  61.39 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2518  integration host factor subunit alpha  62.77 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0778  integration host factor subunit alpha  62.77 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0771  integration host factor subunit alpha  62.77 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.801748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0830  integration host factor subunit alpha  63.83 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120813  normal  0.0891496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1287  integration host factor subunit alpha  62.77 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.921659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1198  integration host factor subunit alpha  61.7 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2924  integration host factor, alpha subunit  65.59 
 
 		 105 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242436  hitchhiker  0.000500218 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1147  integration host factor subunit alpha  59.05 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.205645  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1631  integration host factor subunit alpha  61.7 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  59.79 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  59.79 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  59.79 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  59 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3557  integration host factor subunit alpha  58.06 
 
 		 100 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3294  integration host factor, alpha subunit  58.42 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.13347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0913  integration host factor subunit alpha  58.76 
 
 		 100 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1721  integration host factor subunit alpha  56.7 
 
 		 101 aa  113  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1863  integration host factor subunit alpha  57.73 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00832208  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1417  integration host factor, alpha subunit  52.08 
 
 		 97 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.097817  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  57.73 
 
 		 100 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2365  integration host factor subunit alpha  52.22 
 
 		 98 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0639  integration host factor subunit alpha  56.38 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  54.84 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  48.91 
 
 		 113 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  48.35 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  48.35 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  49.46 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 92 aa  97.1  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  45.05 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3032  integration host factor subunit alpha  51.58 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814183  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  45.56 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  46.67 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  49.47 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  45.56 
 
 		 91 aa  94.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  49.47 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  44.44 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1739  histone family protein DNA-binding protein  51.49 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.269584  decreased coverage  0.000883525 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  48.39 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 99 aa  92  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  47.78 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  44.44 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2237  integration host factor, alpha subunit  46.15 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0376768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2608  integration host factor, alpha subunit  46.15 
 
 		 99 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1805  integration host factor, alpha subunit  47.19 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2066  histone family protein DNA-binding protein  47.37 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151573  normal  0.0307136 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  46.24 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3912  hypothetical protein  84.31 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0376  histone family protein DNA-binding protein  47.83 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  43.33 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  44.94 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3754  histone family protein DNA-binding protein  47.78 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1792  integration host factor subunit alpha  41.84 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704445  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1872  histone family protein DNA-binding protein  43.96 
 
 		 94 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0796  histone family protein DNA-binding protein  48.54 
 
 		 118 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0942374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 91 aa  85.9  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  41.57 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  44.44 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01681  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00950044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1930  integration host factor, alpha subunit  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000106762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1954  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.57207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01670  hypothetical protein  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00452626  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2430  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1931  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000683366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  44.44 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1478  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1919  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.445655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1834  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.155105  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1730  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.976876  normal  0.494462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1467  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1434  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2006  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.608113 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0846  integration host factor subunit alpha  44.94 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000670658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1450  integration host factor subunit alpha  41.24 
 
 		 99 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1957  integration host factor subunit alpha  41.49 
 
 		 99 aa  83.6  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.126843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0762  integration host factor subunit alpha  44.94 
 
 		 101 aa  83.6  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1409  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0010312  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1894  integration host factor subunit alpha  41.49 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.585308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0493  integration host factor subunit alpha  43.33 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2047  integration host factor subunit alpha  41.49 
 
 		 99 aa  83.6  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240665  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1472  integration host factor subunit alpha  47.19 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>