323 genes were found for organism Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bpro_5250  CDS  NC_007950  449  1213  +  765  IclR family transcriptional regulator  YP_552009  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5251  CDS  NC_007950  1229  1891  +  663  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_552010  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5252    NC_007950  1888  2040  +  153      normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5253    NC_007950  2091  2276  +  186      normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5254  CDS  NC_007950  2467  2868  -  402  hypothetical protein  YP_552011  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5255  CDS  NC_007950  2874  4043  -  1170  thiolase  YP_552012  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5256  CDS  NC_007950  4131  5780  -  1650  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  YP_552013  normal  0.242586  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5257  CDS  NC_007950  5869  6354  -  486  hypothetical protein  YP_552014  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5258  CDS  NC_007950  6410  7927  -  1518  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_552015  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5259  CDS  NC_007950  7942  8808  -  867  alpha/beta hydrolase fold  YP_552016  normal  0.956924  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5260  CDS  NC_007950  8805  9509  -  705  transglutaminase-like  YP_552017  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5261  CDS  NC_007950  9506  10402  -  897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_552018  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5262  CDS  NC_007950  10425  10859  -  435  thioesterase superfamily protein  YP_552019  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5263  CDS  NC_007950  10856  11332  -  477  thioesterase superfamily protein  YP_552020  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5264  CDS  NC_007950  11329  12390  -  1062  beta-lactamase-like  YP_552021  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5265  CDS  NC_007950  12393  13538  -  1146  acyl-CoA dehydrogenase-like  YP_552022  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5266  CDS  NC_007950  13535  15568  -  2034  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  YP_552023  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5267  CDS  NC_007950  15606  16403  -  798  enoyl-CoA hydratase  YP_552024  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5268  CDS  NC_007950  16414  18009  -  1596  propionyl-CoA carboxylase  YP_552025  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5269  CDS  NC_007950  18015  18968  -  954  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  YP_552026  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5270  CDS  NC_007950  18987  20984  -  1998  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  YP_552027  normal  0.0127463  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5271  CDS  NC_007950  20999  22606  -  1608  carboxyl transferase  YP_552028  hitchhiker  0.0032202  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5272  CDS  NC_007950  22640  23428  -  789  short chain enoyl-CoA hydratase  YP_552029  hitchhiker  0.0000022289  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5273  CDS  NC_007950  23425  24591  -  1167  acyl-CoA dehydrogenase-like  YP_552030  hitchhiker  0.0000000768741  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5274  CDS  NC_007950  24748  26796  +  2049  2,4-dienoyl-CoA reductase  YP_552031  decreased coverage  0.00000012986  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5275  CDS  NC_007950  26816  27982  +  1167  acyl-CoA dehydrogenase-like  YP_552032  normal  0.033492  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5276  CDS  NC_007950  28076  29242  +  1167  acyl-CoA dehydrogenase-like  YP_552033  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5277  CDS  NC_007950  29239  30408  +  1170  acyl-CoA dehydrogenase-like  YP_552034  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5278  CDS  NC_007950  30405  30812  +  408  hypothetical protein  YP_552035  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5279  CDS  NC_007950  30809  31966  +  1158  thiolase  YP_552036  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5280  CDS  NC_007950  32411  33583  +  1173  hypothetical protein  YP_552037  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5281  CDS  NC_007950  33827  34747  +  921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_552038  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5282  CDS  NC_007950  34762  35619  +  858  MaoC-like dehydratase  YP_552039  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5283  CDS  NC_007950  35682  36485  +  804  enoyl-CoA hydratase  YP_552040  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5284  CDS  NC_007950  36500  37666  +  1167  acyl-CoA dehydrogenase-like  YP_552041  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5285  CDS  NC_007950  37675  38892  +  1218  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_552042  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5286  CDS  NC_007950  39035  39886  +  852  ABC transporter related  YP_552043  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5287  CDS  NC_007950  39873  41819  +  1947  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_552044  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5288  CDS  NC_007950  41823  42710  +  888  inner-membrane translocator  YP_552045  normal  0.653195  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5289  CDS  NC_007950  42716  43789  +  1074  inner-membrane translocator  YP_552046  normal  0.975087  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5290  CDS  NC_007950  43800  44651  +  852  ABC transporter related  YP_552047  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5291  CDS  NC_007950  44768  46024  +  1257  putative branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  YP_552048  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5292  CDS  NC_007950  46280  47077  +  798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_552049  normal  0.609253  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5293  CDS  NC_007950  47150  47782  +  633  TetR family transcriptional regulator  YP_552050  normal  0.199638  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5294  CDS  NC_007950  47864  48373  +  510  MaoC-like dehydratase  YP_552051  normal  0.0746897  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5295  CDS  NC_007950  48429  50114  +  1686  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  YP_552052  normal  0.175772  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5296  CDS  NC_007950  50265  51128  +  864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_552053  normal  0.913032  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5297  CDS  NC_007950  51125  52003  +  879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_552054  normal  0.499574  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5298  CDS  NC_007950  52000  52443  +  444  phenylacetic acid degradation-related protein  YP_552055  normal  0.52092  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5299  CDS  NC_007950  52538  52858  -  321  ferredoxin  YP_552056  normal  0.321771  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5300  CDS  NC_007950  52948  54165  -  1218  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_552057  normal  0.700075  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5301  CDS  NC_007950  54179  55435  -  1257  cytochrome P450  YP_552058  normal  0.717822  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5302  CDS  NC_007950  56095  58260  -  2166  Pyrrolo-quinoline quinone  YP_552059  normal  0.178096  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5303  CDS  NC_007950  58671  60128  +  1458  aldehyde dehydrogenase  YP_552060  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5304  CDS  NC_007950  60195  61835  +  1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_552061  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5305  CDS  NC_007950  61929  63578  +  1650  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  YP_552062  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5306    NC_007950  63642  64564  +  923      normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5307    NC_007950  64631  64912  -  282      normal  0.698229  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5308  CDS  NC_007950  65006  66199  -  1194  ATP-dependent transcription regulator LuxR  YP_552063  normal  0.418046  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5309  CDS  NC_007950  66276  66914  +  639  putative transposase  YP_552064  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5310  CDS  NC_007950  67148  69559  -  2412  hypothetical protein  YP_552065  normal  0.651081  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5311  CDS  NC_007950  69866  70729  -  864  hypothetical protein  YP_552066  normal  0.943993  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5312  CDS  NC_007950  70812  71363  -  552  hypothetical protein  YP_552067  normal  0.587987  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5313  CDS  NC_007950  71360  71992  -  633  hypothetical protein  YP_552068  normal  0.942935  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5314  CDS  NC_007950  71998  72489  -  492  YapH protein  YP_552069  normal  0.752271  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5315  CDS  NC_007950  72789  73076  +  288  hypothetical protein  YP_552070  normal  0.244442  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5316  CDS  NC_007950  73085  73801  -  717  putative transposase  YP_552071  normal  0.110723  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5317  CDS  NC_007950  73794  74108  -  315  transposase  YP_552072  normal  0.353566  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5318  CDS  NC_007950  74228  74692  +  465  prevent-host-death protein  YP_552073  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5319  CDS  NC_007950  74689  75273  +  585  hypothetical protein  YP_552074  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5320    NC_007950  75329  75595  -  267      normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5321  CDS  NC_007950  76119  77624  +  1506  ISPsy20, transposase IstA  YP_552075  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5322  CDS  NC_007950  77617  78444  +  828  IstB-like ATP-binding protein  YP_552076  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5323  CDS  NC_007950  78625  80181  -  1557  beta-ketoacyl synthase  YP_552077  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5324  CDS  NC_007950  80253  82946  -  2694  beta-ketoacyl synthase  YP_552078  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5325  CDS  NC_007950  82947  83921  -  975  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  YP_552079  normal  0.627772  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5326  CDS  NC_007950  83947  84837  -  891  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  YP_552080  normal  1  normal  0.505394  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5327  CDS  NC_007950  84871  85194  -  324  phosphopantetheine-binding  YP_552081  normal  1  normal  0.4619  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5328  CDS  NC_007950  85217  86182  -  966  Delta-9 acyl-phospholipid desaturase  YP_552082  normal  1  normal  0.513576  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5329  CDS  NC_007950  86285  87508  +  1224  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  YP_552083  normal  1  normal  0.5369  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5330  CDS  NC_007950  87562  89388  -  1827  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_552084  normal  1  normal  0.611061  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5331  CDS  NC_007950  89715  91040  -  1326  IS4 family transposase  YP_552085  normal  1  normal  0.385872  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5332  CDS  NC_007950  92450  92944  +  495  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  YP_552086  normal  1  normal  0.676087  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5333  CDS  NC_007950  93113  94414  +  1302  homoserine dehydrogenase  YP_552087  normal  1  normal  0.767379  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5334  CDS  NC_007950  94556  95083  -  528  hypothetical protein  YP_552088  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5335  CDS  NC_007950  95086  95541  -  456  hypothetical protein  YP_552089  normal  1  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5336  CDS  NC_007950  95839  97443  +  1605  hypothetical protein  YP_552090  normal  0.818376  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5337  CDS  NC_007950  97492  99318  -  1827  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  YP_552091  normal  0.0127085  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5338  CDS  NC_007950  99839  100276  -  438  hypothetical protein  YP_552092  hitchhiker  0.0000901533  normal  0.976389  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5339  CDS  NC_007950  100557  100979  -  423  hypothetical protein  YP_552093  decreased coverage  0.0000231528  normal  0.965278  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5340  CDS  NC_007950  101115  101609  -  495  hypothetical protein  YP_552094  hitchhiker  0.000251545  normal  0.961926  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5341  CDS  NC_007950  101663  103372  -  1710  ParB family protein  YP_552095  hitchhiker  0.0017765  normal  0.830623  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5342  CDS  NC_007950  103596  104354  -  759  hypothetical protein  YP_552096  normal  0.0160747  normal  0.725069  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5343  CDS  NC_007950  104655  105422  -  768  IstB-like ATP-binding protein  YP_552097  normal  0.867501  normal  1  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5344  CDS  NC_007950  105460  107031  -  1572  integrase catalytic subunit  YP_552098  normal  1  normal  0.830623  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5345  CDS  NC_007950  107121  108248  -  1128  hypothetical protein  YP_552099  normal  1  normal  0.827686  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5346  CDS  NC_007950  109399  111171  +  1773  hypothetical protein  YP_552100  normal  1  normal  0.696692  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5347  CDS  NC_007950  111487  115494  +  4008  DNA topoisomerase  YP_552101  normal  1  normal  0.195498  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5348  CDS  NC_007950  115491  116279  +  789  hypothetical protein  YP_552102  normal  1  normal  0.109769  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Bpro_5349  CDS  NC_007950  116269  116703  +  435  hypothetical protein  YP_552103  normal  1  normal  0.0980552  Polaromonas sp. JS666  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>