241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5316 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  100 
 
 
238 aa  494  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  87.82 
 
 
238 aa  441  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  99.53 
 
 
212 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  62.93 
 
 
243 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  60.75 
 
 
341 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  60.75 
 
 
263 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  51.87 
 
 
228 aa  222  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  50.93 
 
 
228 aa  219  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  50.93 
 
 
228 aa  219  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  48.88 
 
 
227 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  50.47 
 
 
228 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  47.98 
 
 
230 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  47.98 
 
 
230 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.98 
 
 
230 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.98 
 
 
230 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  48.78 
 
 
235 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  48.78 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  47.8 
 
 
235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  46.83 
 
 
235 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  47.52 
 
 
215 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  45.75 
 
 
222 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  50 
 
 
185 aa  187  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  50 
 
 
185 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  51.16 
 
 
206 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  48.17 
 
 
236 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  45.75 
 
 
218 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  49.4 
 
 
181 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  41.33 
 
 
302 aa  177  1e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  43.54 
 
 
235 aa  177  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  46.57 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  46.88 
 
 
202 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  43.9 
 
 
238 aa  171  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  41.78 
 
 
235 aa  171  9e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  43.72 
 
 
254 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  43.72 
 
 
254 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  43.72 
 
 
264 aa  170  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  40.19 
 
 
235 aa  169  4e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  40.67 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  45.45 
 
 
198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  42.5 
 
 
250 aa  161  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  42.5 
 
 
250 aa  161  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  43.43 
 
 
237 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  42.93 
 
 
234 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  42.93 
 
 
234 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  42.93 
 
 
234 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  42.93 
 
 
234 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  42.93 
 
 
240 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  42.93 
 
 
234 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  42.93 
 
 
240 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  42.93 
 
 
234 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  42.93 
 
 
234 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  42.93 
 
 
240 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  42.93 
 
 
240 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  42.93 
 
 
234 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  42.93 
 
 
240 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  42.93 
 
 
240 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  42.93 
 
 
234 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  42.93 
 
 
240 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  42.93 
 
 
234 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  42.93 
 
 
234 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  42.93 
 
 
234 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  42.93 
 
 
240 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  42.93 
 
 
240 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  42.93 
 
 
240 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  42.93 
 
 
240 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  42.93 
 
 
240 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  42.93 
 
 
240 aa  158  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  37.68 
 
 
246 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  42.42 
 
 
236 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  42.93 
 
 
237 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  40.5 
 
 
250 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  40.5 
 
 
250 aa  156  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  40.5 
 
 
250 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  40.1 
 
 
236 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  40 
 
 
259 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  41.41 
 
 
224 aa  151  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  39.5 
 
 
250 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  37.5 
 
 
346 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  40.84 
 
 
213 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  40.31 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  40.86 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  39.5 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  39.2 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  39 
 
 
250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39 
 
 
346 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  41.79 
 
 
262 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  36.55 
 
 
226 aa  142  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  36.55 
 
 
226 aa  142  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  36.55 
 
 
226 aa  142  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  37.31 
 
 
226 aa  142  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  38 
 
 
250 aa  141  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  39.79 
 
 
212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  37.82 
 
 
226 aa  138  7.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  39.89 
 
 
227 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  40.61 
 
 
236 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  37.63 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  38.66 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  38.66 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  38.66 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>