233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_A0085 on replicon NC_004349
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  100 
 
 
181 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  95.58 
 
 
185 aa  362  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  95.03 
 
 
185 aa  359  9e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  88.4 
 
 
206 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.08 
 
 
230 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  85.08 
 
 
230 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.08 
 
 
230 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  85.08 
 
 
230 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  56.32 
 
 
227 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  51.7 
 
 
228 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  50.57 
 
 
228 aa  191  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  50.57 
 
 
228 aa  191  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  50 
 
 
228 aa  187  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  52.38 
 
 
243 aa  184  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  50.6 
 
 
238 aa  181  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  53.57 
 
 
263 aa  181  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  53.57 
 
 
341 aa  181  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  49.4 
 
 
238 aa  178  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  50 
 
 
212 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  43.5 
 
 
215 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  45.29 
 
 
235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  45.05 
 
 
238 aa  151  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  45.56 
 
 
218 aa  150  8e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  44.51 
 
 
235 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  46.07 
 
 
302 aa  149  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  46.07 
 
 
235 aa  148  4e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  43.35 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  47.89 
 
 
227 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  47.89 
 
 
250 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  48.59 
 
 
250 aa  144  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  48.59 
 
 
250 aa  144  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  42.44 
 
 
226 aa  144  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.89 
 
 
319 aa  144  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  41.62 
 
 
226 aa  144  9e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  41.62 
 
 
226 aa  144  9e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  41.62 
 
 
226 aa  144  9e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  47.18 
 
 
250 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  42.77 
 
 
226 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  44.2 
 
 
264 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  47.18 
 
 
250 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  41.04 
 
 
226 aa  142  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  44.2 
 
 
254 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  44.2 
 
 
254 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  41.52 
 
 
236 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  47.18 
 
 
250 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  44.2 
 
 
255 aa  141  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  47.89 
 
 
250 aa  141  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  42.94 
 
 
226 aa  141  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  42.44 
 
 
236 aa  141  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  41.04 
 
 
226 aa  141  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  43.02 
 
 
234 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  43.02 
 
 
234 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.89 
 
 
346 aa  140  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  43.02 
 
 
234 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  43.02 
 
 
234 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  43.02 
 
 
234 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  43.02 
 
 
240 aa  140  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  43.02 
 
 
240 aa  140  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  43.02 
 
 
234 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  43.02 
 
 
234 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  43.02 
 
 
234 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  43.02 
 
 
234 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  43.02 
 
 
240 aa  140  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  43.02 
 
 
240 aa  140  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  43.02 
 
 
240 aa  140  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  43.02 
 
 
240 aa  140  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  43.02 
 
 
234 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  43.02 
 
 
234 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  43.02 
 
 
240 aa  140  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  41.04 
 
 
226 aa  140  9e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  43.02 
 
 
234 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  41.04 
 
 
226 aa  140  9e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  43.02 
 
 
240 aa  140  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  43.02 
 
 
240 aa  140  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  43.02 
 
 
240 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  43.02 
 
 
240 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  43.02 
 
 
240 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  43.02 
 
 
240 aa  140  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  42.2 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  48.91 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  42.44 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  42.44 
 
 
214 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  45.77 
 
 
246 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  42.44 
 
 
224 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  42.44 
 
 
224 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  45.52 
 
 
346 aa  138  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  42.7 
 
 
235 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  41.04 
 
 
226 aa  137  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  41.04 
 
 
226 aa  137  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  42.13 
 
 
235 aa  137  7e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  41.86 
 
 
224 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  40 
 
 
222 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
224 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
224 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 
224 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  41.86 
 
 
224 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  41.86 
 
 
224 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  41.86 
 
 
224 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  41.86 
 
 
224 aa  136  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  40.46 
 
 
226 aa  136  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>