253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5663 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  100 
 
 
235 aa  490  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  97.87 
 
 
235 aa  478  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  97.45 
 
 
235 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  82.55 
 
 
235 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  89.6 
 
 
202 aa  378  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  75 
 
 
222 aa  339  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  72.22 
 
 
198 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  49.57 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  50 
 
 
243 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  47.84 
 
 
254 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  47.84 
 
 
254 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  47.84 
 
 
264 aa  228  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  47.41 
 
 
238 aa  221  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  50 
 
 
263 aa  214  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  51.26 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  49.52 
 
 
341 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  50.72 
 
 
218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  49.53 
 
 
302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  49.53 
 
 
235 aa  211  5.999999999999999e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  49.29 
 
 
235 aa  211  7e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  48.82 
 
 
235 aa  209  3e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  47.39 
 
 
234 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  47.39 
 
 
234 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  47.39 
 
 
234 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  47.39 
 
 
234 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  47.39 
 
 
234 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  47.39 
 
 
234 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  47.39 
 
 
234 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  47.39 
 
 
234 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  47.39 
 
 
234 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  47.39 
 
 
234 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  47.39 
 
 
234 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  47.39 
 
 
234 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  47.39 
 
 
240 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  47.39 
 
 
240 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  47.39 
 
 
240 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  47.39 
 
 
240 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  47.39 
 
 
240 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  47.39 
 
 
240 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  47.39 
 
 
240 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  47.39 
 
 
240 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  47.39 
 
 
240 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  47.39 
 
 
240 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  47.39 
 
 
240 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  47.39 
 
 
240 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  47.39 
 
 
240 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  46.92 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  48.57 
 
 
238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  47.8 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  46.89 
 
 
228 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  45.93 
 
 
228 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  45.93 
 
 
228 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  45.93 
 
 
228 aa  195  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  48.24 
 
 
212 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  42.92 
 
 
230 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.92 
 
 
230 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  42.92 
 
 
230 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.92 
 
 
230 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  41.1 
 
 
246 aa  190  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  43.52 
 
 
227 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  40.97 
 
 
250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  40.09 
 
 
250 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  40.09 
 
 
250 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  40.17 
 
 
250 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  40.17 
 
 
250 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  38.77 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  38.77 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  45.13 
 
 
215 aa  171  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  39.65 
 
 
246 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  42.44 
 
 
226 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  42.44 
 
 
226 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  40.53 
 
 
250 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  42.44 
 
 
226 aa  170  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  42.44 
 
 
226 aa  168  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.69 
 
 
346 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  40.19 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  40.19 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  37.13 
 
 
236 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  37.89 
 
 
259 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  37.28 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  38.33 
 
 
346 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  39.32 
 
 
224 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  39.32 
 
 
224 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0568  transposase  71.72 
 
 
122 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.084687  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  41.26 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  38.83 
 
 
224 aa  161  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  38.83 
 
 
224 aa  161  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  38.83 
 
 
224 aa  161  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  38.83 
 
 
224 aa  161  9e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  40.78 
 
 
226 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  38.35 
 
 
224 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  38.35 
 
 
224 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  38.99 
 
 
237 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  40.78 
 
 
226 aa  159  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  38.35 
 
 
224 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  38.83 
 
 
214 aa  159  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  38.53 
 
 
236 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  38.35 
 
 
224 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  38.99 
 
 
237 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  40.29 
 
 
236 aa  158  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>