254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1573 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  100 
 
 
238 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  87.82 
 
 
238 aa  441  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  88.68 
 
 
212 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  63.79 
 
 
243 aa  317  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  61.54 
 
 
341 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  61.54 
 
 
263 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  51.33 
 
 
228 aa  224  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  49.12 
 
 
227 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.43 
 
 
230 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  48.43 
 
 
230 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  48.43 
 
 
230 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.43 
 
 
230 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  51.44 
 
 
228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  51.44 
 
 
228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  50.96 
 
 
228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  49.76 
 
 
235 aa  201  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  49.27 
 
 
235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  48.57 
 
 
235 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  48.29 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  48.51 
 
 
215 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  46.23 
 
 
222 aa  190  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  50.58 
 
 
185 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  50.58 
 
 
185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  42.06 
 
 
302 aa  188  5e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  51.16 
 
 
206 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  42.92 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  47.64 
 
 
236 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  50.6 
 
 
181 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  46.31 
 
 
218 aa  179  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  42.47 
 
 
235 aa  178  8e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  41.98 
 
 
235 aa  175  5e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  46.08 
 
 
255 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  44.5 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  47.92 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  40.64 
 
 
235 aa  168  7e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  42.65 
 
 
264 aa  168  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  42.65 
 
 
254 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  42.65 
 
 
254 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  46.59 
 
 
198 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  41.47 
 
 
234 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  41.47 
 
 
234 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  41.47 
 
 
234 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  41.47 
 
 
240 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  41.47 
 
 
234 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  41.47 
 
 
234 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  41.47 
 
 
240 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  41.47 
 
 
234 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  41.47 
 
 
234 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  41.47 
 
 
240 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  41.47 
 
 
234 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  42.29 
 
 
250 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  41.47 
 
 
240 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  41.47 
 
 
234 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  41.47 
 
 
240 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  41.47 
 
 
234 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  41.47 
 
 
234 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  41.47 
 
 
234 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  42.29 
 
 
250 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  41.47 
 
 
240 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  41.47 
 
 
240 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  41.47 
 
 
240 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  41.47 
 
 
240 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  41.47 
 
 
240 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  41.47 
 
 
240 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  41.47 
 
 
240 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  41.47 
 
 
240 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  43.28 
 
 
250 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  40.38 
 
 
250 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  41.46 
 
 
237 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  42.57 
 
 
259 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  37.68 
 
 
246 aa  156  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  42.79 
 
 
250 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  40.8 
 
 
250 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  40.98 
 
 
237 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  40.49 
 
 
236 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  38.81 
 
 
236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  39.9 
 
 
250 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.9 
 
 
346 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  41.79 
 
 
246 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  40.19 
 
 
250 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  37.81 
 
 
346 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  39.51 
 
 
224 aa  148  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  39.22 
 
 
213 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  38.94 
 
 
250 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  40.32 
 
 
224 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  37.95 
 
 
213 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  36.04 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  36.04 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  36.04 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  36.79 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  39.61 
 
 
262 aa  138  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  39.05 
 
 
236 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  40.94 
 
 
227 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  37.82 
 
 
226 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.22 
 
 
319 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  37.37 
 
 
212 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  37.56 
 
 
224 aa  134  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  37.31 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  37.06 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  36.04 
 
 
226 aa  132  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>