259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1668 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1668  transposase  100 
 
 		 341 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  96.15 
 
 		 263 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  74.88 
 
 		 243 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 		 238 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  60.75 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  62.76 
 
 		 212 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  51.82 
 
 		 228 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  49.52 
 
 		 235 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  49.04 
 
 		 235 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  49.75 
 
 		 235 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  50.46 
 
 		 228 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  50.46 
 
 		 228 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  49.04 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  50 
 
 		 228 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  49.01 
 
 		 222 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  49.76 
 
 		 227 aa  205  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.3 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  47.3 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  47.3 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.3 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  50.75 
 
 		 215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  50.26 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  52.91 
 
 		 206 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  53.49 
 
 		 185 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  53.49 
 
 		 185 aa  186  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  53.57 
 
 		 181 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  45.93 
 
 		 235 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  45.93 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  49.44 
 
 		 202 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  47.83 
 
 		 255 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  44.5 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  43.75 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  46.02 
 
 		 198 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  43.4 
 
 		 238 aa  172  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  44.09 
 
 		 218 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  45.37 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  45.97 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  45.97 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  42.11 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  43.12 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  43.12 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  43.12 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  43.12 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  43.46 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  43.12 
 
 		 234 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  43.12 
 
 		 234 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  43.12 
 
 		 234 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  43.12 
 
 		 234 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  43.12 
 
 		 234 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  43.12 
 
 		 234 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  43.12 
 
 		 234 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  43.12 
 
 		 234 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  43.46 
 
 		 240 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  43.46 
 
 		 240 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  43.46 
 
 		 240 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  43.46 
 
 		 240 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  43.46 
 
 		 240 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  43.46 
 
 		 240 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  43.46 
 
 		 240 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  43.46 
 
 		 240 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  43.46 
 
 		 240 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  43.46 
 
 		 240 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  43.46 
 
 		 240 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  43.46 
 
 		 240 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  42.08 
 
 		 237 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  41.09 
 
 		 236 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  42.29 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  41.09 
 
 		 224 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  42.29 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  41.09 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  41.58 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  41.18 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  39.9 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  42.55 
 
 		 224 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  40.69 
 
 		 250 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  41.71 
 
 		 213 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  40.7 
 
 		 213 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  40.3 
 
 		 250 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  38.68 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  40.3 
 
 		 250 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.13 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  39.41 
 
 		 250 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  37.63 
 
 		 214 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  37.63 
 
 		 224 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  36.06 
 
 		 226 aa  140  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  36.19 
 
 		 226 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  39.71 
 
 		 250 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  37.63 
 
 		 224 aa  139  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  37.63 
 
 		 224 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  39.7 
 
 		 212 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  37.32 
 
 		 246 aa  139  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  37.63 
 
 		 224 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  35.71 
 
 		 226 aa  139  7.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  37.63 
 
 		 224 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  37.63 
 
 		 224 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  37.63 
 
 		 224 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  37.63 
 
 		 224 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  35.75 
 
 		 226 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  35.75 
 
 		 226 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  35.71 
 
 		 226 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>