277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3408 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  100 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  88.89 
 
 		 236 aa  408  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  90.61 
 
 		 213 aa  397  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  83.05 
 
 		 236 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  89.73 
 
 		 236 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  86.38 
 
 		 213 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  83.56 
 
 		 237 aa  381  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  83.11 
 
 		 237 aa  374  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  87.62 
 
 		 212 aa  367  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  82.81 
 
 		 224 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  90.06 
 
 		 228 aa  339  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  89.35 
 
 		 169 aa  294  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4096  IS6 family transposase  89.71 
 
 		 175 aa  290  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  84.15 
 
 		 175 aa  285  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  86.93 
 
 		 211 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1778  transposase  76.36 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.887632  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7111  putative transposase  84.62 
 
 		 135 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  44.02 
 
 		 218 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  43.6 
 
 		 238 aa  175  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  39.53 
 
 		 302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  43.81 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  43.81 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  43.81 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  40.29 
 
 		 235 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  39.9 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  40.19 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  42.64 
 
 		 243 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  41.23 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  39.51 
 
 		 235 aa  165  9e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  41.15 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  39.71 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6782  hypothetical protein  79.38 
 
 		 132 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  40.2 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  41.79 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  41.15 
 
 		 240 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  41.15 
 
 		 234 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  41.15 
 
 		 234 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  41.15 
 
 		 234 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  41.15 
 
 		 234 aa  158  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  41.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  41.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  41.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  41.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  41.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  41.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  41.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  41.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  41.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  41.15 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  36.84 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  41.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  41.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  41.15 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  41.15 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  41.15 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  41.15 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  41.15 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  41.15 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  41.15 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  41.15 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  39.61 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  43.07 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  41.75 
 
 		 212 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  40.61 
 
 		 222 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  42.57 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  40.77 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  43.59 
 
 		 233 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  37.8 
 
 		 228 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  34.65 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.65 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  34.65 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.65 
 
 		 230 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  39.34 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  39.34 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  38.35 
 
 		 346 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  35.78 
 
 		 214 aa  143  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  38.86 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  40.1 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  40.1 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  41.42 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  41.42 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  41.42 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  41.42 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  41.42 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  40.83 
 
 		 224 aa  142  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  40.83 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  40.83 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  42.01 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  40.83 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0020  IS431mec-like transposase  40.83 
 
 		 224 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  40.83 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  40.83 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  40.83 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  38.66 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  38.66 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  38.66 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  41.06 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>