253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8473 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  100 
 
 		 233 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  83.69 
 
 		 233 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  83.26 
 
 		 233 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  83.26 
 
 		 233 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  83.26 
 
 		 233 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  83.26 
 
 		 233 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  78.11 
 
 		 233 aa  357  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  49.78 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  49.78 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  49.78 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  49.78 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  49.78 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  49.12 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  47.86 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  49.34 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  50.67 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  49.35 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  48.48 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  48.05 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  48.92 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  48.48 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  47.6 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  47.6 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  47.6 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  47.6 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  47.6 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  47.6 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  47.6 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  48.48 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  43.3 
 
 		 236 aa  188  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  48.46 
 
 		 236 aa  184  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  51.56 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  48.02 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  48.02 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  44.59 
 
 		 242 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  44.59 
 
 		 242 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  44.59 
 
 		 242 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  44.59 
 
 		 242 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  44.1 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  44.59 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  44.59 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  43.23 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  44.59 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  52.3 
 
 		 180 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  46.45 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  44.39 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  44.39 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  44.39 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  43.75 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  51.97 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  42.35 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  44.39 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  43.88 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  43.88 
 
 		 236 aa  148  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  44.62 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  42.35 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  43.59 
 
 		 262 aa  141  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  37.97 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  37.97 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  41.84 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  37.23 
 
 		 226 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  38.5 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  44.09 
 
 		 213 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  43.55 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1459  IS6 family transposase  48.08 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835209  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  36.9 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  36.9 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  36.9 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  37.97 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  36.36 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  37.43 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  34.06 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  37.43 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  34.06 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  36.36 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  36.9 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  35.48 
 
 		 236 aa  131  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  36.62 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  36.9 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  33.33 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  34.92 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  38.54 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  38.54 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  38.54 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  38.54 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  38.54 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  34.54 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  39.32 
 
 		 254 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  39.32 
 
 		 254 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  39.32 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  38.54 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  38.54 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  38.54 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  38.54 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  38.54 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  38.54 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  38.54 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  38.54 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  38.54 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  38.54 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>