254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8012 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  100 
 
 
238 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  98.74 
 
 
238 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  98.32 
 
 
238 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  86.13 
 
 
238 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  85.29 
 
 
238 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  82.35 
 
 
243 aa  410  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  81.93 
 
 
238 aa  404  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  86.29 
 
 
180 aa  318  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  64.53 
 
 
237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  65.33 
 
 
237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  79.65 
 
 
196 aa  285  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  70.05 
 
 
232 aa  268  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  54.05 
 
 
236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  57.64 
 
 
233 aa  230  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  57.64 
 
 
233 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  57.21 
 
 
233 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  57.64 
 
 
233 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  57.64 
 
 
233 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  51.09 
 
 
233 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  54.82 
 
 
236 aa  214  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  54.39 
 
 
236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  54.39 
 
 
236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  48.48 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  46.12 
 
 
232 aa  192  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8072  transposase  98.94 
 
 
94 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  45.76 
 
 
237 aa  191  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  45.76 
 
 
237 aa  191  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  45.76 
 
 
237 aa  191  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  45.76 
 
 
237 aa  191  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  45.76 
 
 
237 aa  191  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  45.76 
 
 
237 aa  191  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  45.76 
 
 
237 aa  191  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  47.01 
 
 
231 aa  190  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  44.98 
 
 
233 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  44.98 
 
 
233 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  44.98 
 
 
233 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  44.98 
 
 
233 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  44.98 
 
 
233 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  44.05 
 
 
238 aa  181  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  44.05 
 
 
238 aa  181  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  44.05 
 
 
238 aa  181  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  43.61 
 
 
238 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  43.1 
 
 
242 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  43.1 
 
 
242 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  43.1 
 
 
242 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  43.1 
 
 
242 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  44.02 
 
 
231 aa  178  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  43.72 
 
 
233 aa  178  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  43.1 
 
 
242 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  43.1 
 
 
242 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  44.29 
 
 
251 aa  168  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7541  transposase  83.16 
 
 
119 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7263  transposase  79.57 
 
 
104 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  37.57 
 
 
226 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  37.57 
 
 
226 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  37.57 
 
 
226 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  37.85 
 
 
226 aa  122  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1459  IS6 family transposase  43.67 
 
 
162 aa  118  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835209  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  35.91 
 
 
226 aa  118  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  35.36 
 
 
236 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  34.81 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  34.81 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  35.36 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  34.81 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  34.05 
 
 
226 aa  113  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  34.81 
 
 
226 aa  112  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  34.25 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  34.25 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  33.7 
 
 
226 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  37.31 
 
 
236 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  37.97 
 
 
213 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  37.43 
 
 
212 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  37.5 
 
 
236 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  36.98 
 
 
224 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  36.46 
 
 
236 aa  105  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  36.46 
 
 
237 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  33.68 
 
 
235 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  36.46 
 
 
237 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  35.83 
 
 
213 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1460  transposase  45.65 
 
 
166 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  32.61 
 
 
235 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  37.5 
 
 
238 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  31.58 
 
 
302 aa  100  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  32.63 
 
 
235 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  33.15 
 
 
222 aa  99.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  35.83 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  32.63 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  35.71 
 
 
164 aa  97.1  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  37.95 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  35.83 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  35.83 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  31.58 
 
 
235 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  35.83 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  38.02 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  38.17 
 
 
263 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  31.41 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  34.22 
 
 
238 aa  95.1  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  32.81 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  33.67 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  32.28 
 
 
218 aa  91.7  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>