230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1459 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1459  IS6 family transposase  100 
 
 		 162 aa  329  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835209  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  82.1 
 
 		 238 aa  280  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  82.1 
 
 		 238 aa  279  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  82.1 
 
 		 238 aa  279  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  82.1 
 
 		 238 aa  279  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1460  transposase  99.27 
 
 		 166 aa  275  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  64.38 
 
 		 231 aa  217  5e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  63.98 
 
 		 232 aa  216  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  63.52 
 
 		 231 aa  213  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0790  transposase, putative  73.64 
 
 		 110 aa  163  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245034  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  48.08 
 
 		 233 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  42.86 
 
 		 243 aa  120  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  44.23 
 
 		 233 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  44.23 
 
 		 233 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  44.23 
 
 		 233 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  44.23 
 
 		 233 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  44.23 
 
 		 233 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  42.95 
 
 		 238 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  49.22 
 
 		 233 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  49.22 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  49.22 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  42.31 
 
 		 238 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  49.22 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  48.03 
 
 		 233 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  41.72 
 
 		 233 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  47.83 
 
 		 242 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  42.77 
 
 		 237 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  47.83 
 
 		 242 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  47.83 
 
 		 242 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  47.83 
 
 		 242 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  47.66 
 
 		 233 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  44.51 
 
 		 237 aa  110  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  47.1 
 
 		 242 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  32.26 
 
 		 236 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  47.1 
 
 		 242 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  40 
 
 		 236 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  42.68 
 
 		 196 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  40 
 
 		 236 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  40 
 
 		 236 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  43.67 
 
 		 238 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  43.67 
 
 		 238 aa  104  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  41.18 
 
 		 238 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  51.54 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  43.04 
 
 		 238 aa  101  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  51.89 
 
 		 180 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  39.22 
 
 		 251 aa  91.3  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  39.1 
 
 		 237 aa  85.1  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  39.1 
 
 		 237 aa  85.1  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  39.1 
 
 		 237 aa  85.1  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  39.1 
 
 		 237 aa  85.1  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  39.1 
 
 		 237 aa  85.1  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  39.1 
 
 		 237 aa  85.1  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  39.1 
 
 		 237 aa  85.1  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  35.2 
 
 		 228 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  33.6 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  34.33 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  34.4 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  34.4 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  34.35 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  35.65 
 
 		 235 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  35.2 
 
 		 237 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  36.89 
 
 		 226 aa  77.4  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  36.89 
 
 		 226 aa  77.4  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  32.82 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  36.89 
 
 		 226 aa  77.4  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  37.39 
 
 		 235 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  35.65 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  34.33 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  34.4 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  33.6 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  37.61 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  34.78 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  35.2 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  32.82 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  35.54 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  34.78 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  35.14 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  36.07 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  34.43 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  34.26 
 
 		 226 aa  73.9  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  34.26 
 
 		 226 aa  73.9  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  34.26 
 
 		 226 aa  73.9  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  34.26 
 
 		 226 aa  73.9  0.0000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  34.71 
 
 		 226 aa  73.9  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  35.59 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  35.65 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  35.61 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  34.45 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  35.2 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  35.25 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  35.25 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  33.08 
 
 		 302 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  35.25 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  33.08 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  34.69 
 
 		 208 aa  70.9  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  34.69 
 
 		 214 aa  70.9  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  32.58 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  33.67 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  33.67 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  35.54 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>