225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7084 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  100 
 
 		 169 aa  346  9e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  91.72 
 
 		 228 aa  320  5e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  91.12 
 
 		 213 aa  319  9.000000000000001e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  82.84 
 
 		 213 aa  295  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  89.35 
 
 		 262 aa  289  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  86.71 
 
 		 212 aa  287  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4096  IS6 family transposase  92.31 
 
 		 175 aa  285  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  85.44 
 
 		 175 aa  278  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  84.18 
 
 		 236 aa  277  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  79.88 
 
 		 237 aa  275  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  79.29 
 
 		 236 aa  272  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  86.62 
 
 		 236 aa  266  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  77.51 
 
 		 237 aa  265  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  79.22 
 
 		 224 aa  249  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1778  transposase  71.9 
 
 		 250 aa  177  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.887632  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7111  putative transposase  85.42 
 
 		 135 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6782  hypothetical protein  81.44 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  80.21 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3163  putative transposase  64.29 
 
 		 96 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2530  hypothetical protein  67.02 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  39.58 
 
 		 302 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  39.58 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  43.07 
 
 		 218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  40.56 
 
 		 235 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  39.16 
 
 		 235 aa  105  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4169  hypothetical protein  44.3 
 
 		 248 aa  105  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  39.86 
 
 		 235 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  40.56 
 
 		 235 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  39.44 
 
 		 212 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  39.35 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 264 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  42.03 
 
 		 254 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  42.03 
 
 		 254 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  39.16 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  39.22 
 
 		 255 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  40.58 
 
 		 238 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  39.31 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  38.73 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  35.48 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  36.54 
 
 		 235 aa  101  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  37.76 
 
 		 238 aa  95.5  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  34.97 
 
 		 235 aa  95.1  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  36.88 
 
 		 234 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  36.88 
 
 		 234 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  36.88 
 
 		 234 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  36.88 
 
 		 234 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  36.88 
 
 		 240 aa  94.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  36.88 
 
 		 234 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  36.88 
 
 		 234 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  36.88 
 
 		 240 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  36.88 
 
 		 240 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  36.88 
 
 		 240 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  42.97 
 
 		 236 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  36.88 
 
 		 240 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  36.88 
 
 		 240 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  36.88 
 
 		 240 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  36.88 
 
 		 240 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  36.88 
 
 		 240 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  36.88 
 
 		 240 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  36.88 
 
 		 240 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  36.88 
 
 		 240 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  36.88 
 
 		 240 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  38.1 
 
 		 234 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  38.1 
 
 		 234 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  38.1 
 
 		 234 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  36.88 
 
 		 234 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  36.88 
 
 		 234 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  36.88 
 
 		 234 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  31.93 
 
 		 227 aa  91.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  34.38 
 
 		 236 aa  91.3  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  39.71 
 
 		 233 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  41.41 
 
 		 222 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  37.67 
 
 		 263 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  36.77 
 
 		 341 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7085  transposase  36.91 
 
 		 222 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0314847  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  33.87 
 
 		 232 aa  84.7  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  37.16 
 
 		 228 aa  84.3  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  37.16 
 
 		 228 aa  84.3  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  35.81 
 
 		 242 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  35.81 
 
 		 242 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  35.81 
 
 		 242 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  35.81 
 
 		 242 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  37.21 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  32.47 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  37.21 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  37.21 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  37.21 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  33.58 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0477  putative transposase  72.73 
 
 		 62 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  38.06 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  38.06 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  38.06 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  38.06 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  38.06 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  38.06 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  38.06 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  36.43 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  36.49 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  36.96 
 
 		 236 aa  81.3  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  37.21 
 
 		 233 aa  80.9  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>