270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2850 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2850  transposase  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  92.44 
 
 		 236 aa  324  6e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  95.51 
 
 		 237 aa  323  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  91.28 
 
 		 224 aa  313  8e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  90.96 
 
 		 237 aa  308  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  82.32 
 
 		 236 aa  278  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  75.12 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1778  transposase  77.53 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.887632  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  86.93 
 
 		 262 aa  251  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  85.11 
 
 		 213 aa  247  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  84.4 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  80.85 
 
 		 212 aa  236  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7111  putative transposase  87.18 
 
 		 135 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  81.65 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  75.73 
 
 		 175 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4096  IS6 family transposase  82.52 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  40.88 
 
 		 302 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  41.86 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  80.21 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  40.7 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  44.51 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  47.26 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  47.45 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  46.67 
 
 		 228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  37.88 
 
 		 240 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  37.88 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  40.12 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  37.88 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  37.88 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  37.88 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  37.88 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  44.06 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  37.88 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  37.88 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  37.88 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  37.88 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  37.88 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  43.6 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  37.88 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  37.88 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  43.6 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  37.88 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  37.88 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  37.88 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  37.88 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  43.6 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  37.88 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  37.88 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  37.88 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  37.88 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  37.88 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  37.88 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  37.88 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  37.88 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  43.6 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  44.93 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  43.36 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  47.79 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  47.79 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  46.62 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  44.9 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  44.06 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  42.66 
 
 		 230 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  47.33 
 
 		 238 aa  131  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  42.66 
 
 		 230 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.66 
 
 		 230 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.66 
 
 		 230 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  37.02 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  47.06 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  43.57 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  43.36 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  46.53 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  45.83 
 
 		 341 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  42.96 
 
 		 227 aa  128  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  43.26 
 
 		 185 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  42.55 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  46.25 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  43.57 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45 
 
 		 319 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  45.04 
 
 		 238 aa  124  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  45 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  39.9 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  46.77 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45 
 
 		 346 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  45 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  33.66 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  43.75 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  42.41 
 
 		 233 aa  121  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  45.71 
 
 		 250 aa  121  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  45.71 
 
 		 250 aa  121  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  33.65 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  43.08 
 
 		 224 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  44.06 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  33.17 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  43.75 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  41.91 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  41.91 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  41.91 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  41.91 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  43.08 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>