220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7111 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7111  putative transposase  100 
 
 		 135 aa  269  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  84.62 
 
 		 213 aa  213  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  88.89 
 
 		 237 aa  212  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  88.89 
 
 		 236 aa  211  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  87.18 
 
 		 237 aa  211  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  87.18 
 
 		 211 aa  211  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  83.76 
 
 		 213 aa  209  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 212 aa  208  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  85.47 
 
 		 224 aa  203  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  82.91 
 
 		 236 aa  203  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  74.81 
 
 		 228 aa  202  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1778  transposase  82.05 
 
 		 250 aa  197  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.887632  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  86.32 
 
 		 236 aa  191  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 262 aa  186  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  79.61 
 
 		 175 aa  172  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4096  IS6 family transposase  86.41 
 
 		 175 aa  160  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  85.42 
 
 		 169 aa  157  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  42.98 
 
 		 212 aa  105  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  43.22 
 
 		 228 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  42.98 
 
 		 238 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  45.54 
 
 		 243 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  45.13 
 
 		 235 aa  101  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4169  hypothetical protein  50.93 
 
 		 248 aa  100  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  42.4 
 
 		 302 aa  100  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  42.24 
 
 		 235 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  42.24 
 
 		 235 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  42.4 
 
 		 235 aa  100  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  48.51 
 
 		 263 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  41.38 
 
 		 235 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  49.02 
 
 		 228 aa  99.4  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  49.02 
 
 		 228 aa  99.4  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  47.52 
 
 		 341 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  37.1 
 
 		 198 aa  98.6  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  43.86 
 
 		 235 aa  98.6  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  43.22 
 
 		 235 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  40.35 
 
 		 238 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  41.74 
 
 		 202 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  43.44 
 
 		 236 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  48.04 
 
 		 228 aa  96.7  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  44.92 
 
 		 234 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  44.92 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  44.92 
 
 		 234 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  43.44 
 
 		 238 aa  95.5  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  44.92 
 
 		 234 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  44.92 
 
 		 234 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  44.92 
 
 		 234 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  44.92 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  44.92 
 
 		 234 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  44.92 
 
 		 234 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  44.92 
 
 		 234 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  44.92 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  44.92 
 
 		 234 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  44.92 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  44.92 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  44.92 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  44.92 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  44.92 
 
 		 234 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  44.92 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  44.92 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  44.92 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  44.92 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  44.92 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  44.92 
 
 		 240 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  43.7 
 
 		 218 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  44.92 
 
 		 234 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  44.92 
 
 		 234 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  43.93 
 
 		 181 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  43.4 
 
 		 215 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  43.93 
 
 		 230 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.93 
 
 		 230 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.93 
 
 		 230 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  41.38 
 
 		 222 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  43.93 
 
 		 230 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 		 264 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  40.59 
 
 		 227 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  46.15 
 
 		 254 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  46.15 
 
 		 254 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  42.2 
 
 		 206 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  42.99 
 
 		 185 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  42.99 
 
 		 185 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  40.71 
 
 		 235 aa  90.9  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  43.59 
 
 		 255 aa  90.5  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  43.33 
 
 		 250 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  39.29 
 
 		 346 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  42.5 
 
 		 250 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  42.5 
 
 		 250 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  41.67 
 
 		 250 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  48.21 
 
 		 236 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.53 
 
 		 319 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  39.81 
 
 		 224 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  39.66 
 
 		 227 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  36.63 
 
 		 208 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  35.65 
 
 		 236 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  37.62 
 
 		 224 aa  84  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  37.62 
 
 		 224 aa  84  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  37.62 
 
 		 224 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  37.62 
 
 		 224 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  37.62 
 
 		 224 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  37.62 
 
 		 224 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  37.62 
 
 		 224 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>