230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4096 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4096  IS6 family transposase  100 
 
 		 175 aa  357  5e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  94.86 
 
 		 228 aa  338  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  94.29 
 
 		 213 aa  337  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  84 
 
 		 213 aa  310  7.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  92.31 
 
 		 169 aa  300  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  89.71 
 
 		 262 aa  300  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  85.98 
 
 		 212 aa  294  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  85.37 
 
 		 236 aa  291  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  81.14 
 
 		 237 aa  291  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  80.57 
 
 		 236 aa  288  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  85.37 
 
 		 175 aa  287  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  78.86 
 
 		 237 aa  281  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  86.5 
 
 		 236 aa  280  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  79.87 
 
 		 224 aa  261  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1778  transposase  73.23 
 
 		 250 aa  191  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.887632  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7111  putative transposase  86.41 
 
 		 135 aa  191  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  82.52 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6782  hypothetical protein  78.35 
 
 		 132 aa  160  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3163  putative transposase  65.31 
 
 		 96 aa  124  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2530  hypothetical protein  78.48 
 
 		 170 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4169  hypothetical protein  45.1 
 
 		 248 aa  111  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  36.72 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  38.56 
 
 		 243 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  36.16 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  38.12 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  34.76 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  34.76 
 
 		 302 aa  105  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  37.04 
 
 		 238 aa  104  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  35.54 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 198 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  36.88 
 
 		 235 aa  101  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  38.93 
 
 		 235 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  40.82 
 
 		 236 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  37.04 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  38.93 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  35.44 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  39.86 
 
 		 264 aa  99.4  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  36.25 
 
 		 235 aa  99  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  39.86 
 
 		 254 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  39.86 
 
 		 254 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  37.5 
 
 		 255 aa  97.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  34.97 
 
 		 235 aa  96.3  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  37.74 
 
 		 263 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  37.74 
 
 		 341 aa  95.9  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  31.14 
 
 		 227 aa  95.5  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  37.84 
 
 		 222 aa  92.8  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  36.42 
 
 		 234 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  36.42 
 
 		 234 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  33.53 
 
 		 236 aa  92.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  36.42 
 
 		 234 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  36.42 
 
 		 234 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  36.42 
 
 		 240 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  31.93 
 
 		 235 aa  92.4  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  36.42 
 
 		 240 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  36.42 
 
 		 240 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  36.42 
 
 		 240 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  36.42 
 
 		 240 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  36.42 
 
 		 240 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  36.42 
 
 		 234 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  36.42 
 
 		 240 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  36.42 
 
 		 234 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  36.42 
 
 		 234 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  36.42 
 
 		 240 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  36.42 
 
 		 240 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  36.42 
 
 		 240 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  36.42 
 
 		 240 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  36.42 
 
 		 240 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  36.42 
 
 		 234 aa  92  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  36.42 
 
 		 240 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  36.42 
 
 		 234 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  36.42 
 
 		 234 aa  91.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  38.62 
 
 		 233 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  36.42 
 
 		 234 aa  91.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  36.42 
 
 		 234 aa  91.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  38.27 
 
 		 236 aa  88.2  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  35.82 
 
 		 346 aa  87.8  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  32.08 
 
 		 228 aa  87.4  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  35.19 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  35.19 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  34.01 
 
 		 233 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  34.01 
 
 		 233 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  34.01 
 
 		 233 aa  85.5  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  34.01 
 
 		 233 aa  85.1  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  31.54 
 
 		 232 aa  84.7  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  35.1 
 
 		 237 aa  84.7  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  35.1 
 
 		 237 aa  84.7  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  35.1 
 
 		 237 aa  84.7  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  35.1 
 
 		 237 aa  84.7  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  35.1 
 
 		 237 aa  84.7  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  35.1 
 
 		 237 aa  84.7  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  35.1 
 
 		 237 aa  84.7  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  34.57 
 
 		 228 aa  84  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  34.01 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  38.06 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  34.18 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  34.18 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  34.18 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  34.18 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  38.06 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  45 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>