37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6782 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6782  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  79.38 
 
 
213 aa  168  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  81.44 
 
 
228 aa  167  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  80.41 
 
 
213 aa  165  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  81.44 
 
 
169 aa  164  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  79.38 
 
 
262 aa  164  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  88.37 
 
 
212 aa  163  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4096  IS6 family transposase  78.35 
 
 
175 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  82.56 
 
 
236 aa  153  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  82.56 
 
 
175 aa  152  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  82.35 
 
 
236 aa  149  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  65.98 
 
 
237 aa  130  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  64.95 
 
 
236 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  63.92 
 
 
237 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3163  putative transposase  63.27 
 
 
96 aa  123  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390311  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  65.85 
 
 
224 aa  116  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2530  hypothetical protein  70.59 
 
 
170 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0477  putative transposase  65.45 
 
 
62 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1778  transposase  59.57 
 
 
250 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.887632  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4638  hypothetical protein  78.79 
 
 
51 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  36.36 
 
 
218 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  29.63 
 
 
302 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  29.63 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  32.05 
 
 
238 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  28.72 
 
 
255 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3733  hypothetical protein  74.07 
 
 
131 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7111  putative transposase  80 
 
 
135 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
264 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  33.33 
 
 
254 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  33.33 
 
 
254 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  31.17 
 
 
198 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  30 
 
 
235 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  28.75 
 
 
235 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3263  putative transposase  77.78 
 
 
27 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  28.21 
 
 
202 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  28.75 
 
 
235 aa  42.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7085  transposase  30.77 
 
 
222 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0314847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>