250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8446 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  99.57 
 
 
233 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  83.26 
 
 
233 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  73.82 
 
 
233 aa  341  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  50 
 
 
233 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  50 
 
 
233 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  49.56 
 
 
233 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  49.56 
 
 
233 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  49.56 
 
 
233 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  48.25 
 
 
233 aa  211  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  47.96 
 
 
237 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  47.51 
 
 
243 aa  195  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  46.67 
 
 
238 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  46.32 
 
 
237 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  46.15 
 
 
238 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  45.33 
 
 
238 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  48.67 
 
 
236 aa  185  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  48.23 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  48.23 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  46.22 
 
 
237 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  46.22 
 
 
237 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  45.41 
 
 
238 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  46.22 
 
 
237 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  46.22 
 
 
237 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  46.22 
 
 
237 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  46.22 
 
 
237 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  46.22 
 
 
237 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  45.41 
 
 
238 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  44.98 
 
 
238 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  43.38 
 
 
236 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  45.33 
 
 
242 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  45.33 
 
 
242 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  45.33 
 
 
242 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  45.33 
 
 
242 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  45.33 
 
 
242 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  45.33 
 
 
242 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  44.8 
 
 
231 aa  174  9e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  44.34 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  45.62 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  50.26 
 
 
232 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  51.74 
 
 
180 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  42.47 
 
 
238 aa  158  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  42.47 
 
 
238 aa  158  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  42.47 
 
 
238 aa  158  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  44.55 
 
 
251 aa  157  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  42.01 
 
 
238 aa  154  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  47.37 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  33.84 
 
 
226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  33.84 
 
 
226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  37 
 
 
236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  33.17 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  39.29 
 
 
237 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  39 
 
 
236 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  41.24 
 
 
212 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  36.57 
 
 
226 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  36.57 
 
 
226 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  36.57 
 
 
226 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  39.68 
 
 
236 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  35.43 
 
 
226 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  34.22 
 
 
226 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  34.76 
 
 
226 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  34.22 
 
 
226 aa  123  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  30.65 
 
 
227 aa  121  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  121  8e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  121  9e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  36.98 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  36.98 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  36.98 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  36.98 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  36.98 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  36.98 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  36.98 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  36.98 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  36.98 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  36.98 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  36.98 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  36.98 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  36.98 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  36.98 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  36.98 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  36.98 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  36.98 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  36.98 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  36.98 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  36.98 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  36.98 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  36.98 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  37.76 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  33.69 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  36 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  36.98 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  36.98 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  36.98 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1459  IS6 family transposase  44.23 
 
 
162 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835209  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  34.29 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  33.16 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  39.25 
 
 
213 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>