245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2762 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  68.16 
 
 
237 aa  309  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  68.16 
 
 
237 aa  309  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  68.16 
 
 
237 aa  309  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  68.16 
 
 
237 aa  309  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  68.16 
 
 
237 aa  309  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  68.16 
 
 
237 aa  309  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  68.16 
 
 
237 aa  309  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  45.91 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  46.45 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  40.83 
 
 
236 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  45.21 
 
 
243 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  45 
 
 
238 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  44.55 
 
 
238 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  45 
 
 
238 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  44.29 
 
 
236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  44.55 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  44.29 
 
 
238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  47.34 
 
 
242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  47.34 
 
 
242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  47.34 
 
 
242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  47.34 
 
 
242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  43.84 
 
 
236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  43.84 
 
 
236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  46.19 
 
 
233 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  42.66 
 
 
237 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  46.7 
 
 
233 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  46.97 
 
 
233 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  46.97 
 
 
233 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  46.97 
 
 
233 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  46.81 
 
 
242 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  46.81 
 
 
242 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  44.55 
 
 
233 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  44.55 
 
 
233 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  44.55 
 
 
233 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  44.55 
 
 
233 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  44.55 
 
 
233 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  44.22 
 
 
233 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  48.65 
 
 
180 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  43.36 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  40.35 
 
 
231 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  38.6 
 
 
231 aa  142  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  39.35 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  39.35 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  39.35 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  38.5 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  39.04 
 
 
232 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  43.37 
 
 
232 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  41.03 
 
 
233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  34.81 
 
 
227 aa  125  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  34.33 
 
 
226 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  34.33 
 
 
226 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  34.33 
 
 
226 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  35.56 
 
 
228 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  34.52 
 
 
226 aa  122  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  36.11 
 
 
228 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  36.11 
 
 
228 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  40.1 
 
 
236 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  37.02 
 
 
238 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  41.97 
 
 
213 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  36.31 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  41.12 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  35.56 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  37.95 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  36.26 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  36.26 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  35.23 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  40.61 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  36.26 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  41.45 
 
 
212 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  42.42 
 
 
262 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  36.26 
 
 
226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  40.1 
 
 
237 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  36.53 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  39.59 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  35.67 
 
 
226 aa  113  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  35.09 
 
 
226 aa  113  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  35.71 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  39.58 
 
 
213 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  41.62 
 
 
236 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  35.93 
 
 
226 aa  111  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  35.83 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  35.83 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2299  hypothetical protein  71.62 
 
 
74 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  35.93 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  36.36 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  36.13 
 
 
234 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  36.13 
 
 
234 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  34.07 
 
 
230 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  36.13 
 
 
234 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  34.07 
 
 
230 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  36.13 
 
 
234 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  40.91 
 
 
254 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.07 
 
 
230 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  34.3 
 
 
226 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  40.91 
 
 
254 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.07 
 
 
230 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  40.91 
 
 
264 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  34.29 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  36.13 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>