217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7470 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7470  transposase  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  80.81 
 
 		 243 aa  287  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  80.35 
 
 		 238 aa  286  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  78.61 
 
 		 238 aa  279  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  78.03 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  80.23 
 
 		 238 aa  268  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  79.65 
 
 		 238 aa  267  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  79.65 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  64.74 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  67.06 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  89.08 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  67.13 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  50 
 
 		 236 aa  171  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  53.05 
 
 		 233 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  52.44 
 
 		 233 aa  158  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  52.44 
 
 		 233 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  52.44 
 
 		 233 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  52.44 
 
 		 233 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  51.97 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  49.69 
 
 		 233 aa  147  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  52.23 
 
 		 236 aa  144  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  51.59 
 
 		 236 aa  141  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  51.59 
 
 		 236 aa  141  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7263  transposase  75 
 
 		 104 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  47.37 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  47.37 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  47.37 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  47.37 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  47.37 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  43.1 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  46.05 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  40.23 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  40.23 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  40.23 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  41.48 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  39.66 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  39.43 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  39.43 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  39.43 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  39.43 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  39.43 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  39.43 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  39.43 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1459  IS6 family transposase  42.68 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835209  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  38.55 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  38.6 
 
 		 251 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  38.55 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  38.55 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  38.55 
 
 		 242 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  38.55 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  38.55 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9132  transposase  84.91 
 
 		 53 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1460  transposase  42.75 
 
 		 166 aa  91.3  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  35.96 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  35.96 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  35.96 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  35.96 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  35.96 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  35.09 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  35.09 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  33.33 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  33.33 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  33.33 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  34.21 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  34.21 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  34.21 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  34.21 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  34.21 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  35.88 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  36.64 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  35.11 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  35.11 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  34.15 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  34.15 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  35.11 
 
 		 175 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  34.35 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  33.33 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  33.33 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  35.11 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  33.33 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  32.79 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  35.66 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5740  IS6 family transposase  35.34 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  33.64 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  33.59 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  34.92 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  33.7 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  35.04 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0790  transposase, putative  36.36 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245034  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  32.56 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 236 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  34.92 
 
 		 341 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  30.95 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  36.75 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  36.75 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  44.59 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  35.59 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  29.46 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>