57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7263 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7263  transposase  100 
 
 
104 aa  218  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  87.37 
 
 
238 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  81.72 
 
 
243 aa  157  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  79.57 
 
 
238 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  78.49 
 
 
238 aa  154  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  79.57 
 
 
238 aa  143  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  79.57 
 
 
238 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  75 
 
 
196 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  78.49 
 
 
238 aa  139  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  63.83 
 
 
237 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  60 
 
 
237 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  48.89 
 
 
233 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  48.89 
 
 
233 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  48.89 
 
 
233 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  48.89 
 
 
233 aa  88.2  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  48.98 
 
 
233 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  47.78 
 
 
233 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  47.78 
 
 
233 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  44.09 
 
 
236 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9132  transposase  70.59 
 
 
53 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  46.07 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  78.95 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  44.94 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  44.94 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  44.79 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  44.79 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  44.79 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  43.88 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  44.79 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  41.76 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  40.62 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  91.43 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  41.94 
 
 
231 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5740  IS6 family transposase  40.43 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  35.11 
 
 
237 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  35.11 
 
 
237 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  35.11 
 
 
237 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  35.11 
 
 
237 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  35.11 
 
 
237 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  35.11 
 
 
237 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  35.11 
 
 
237 aa  62.4  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  34.83 
 
 
231 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  37.93 
 
 
238 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  37.93 
 
 
238 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  37.93 
 
 
238 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1460  transposase  37.5 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1459  IS6 family transposase  36.67 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  36.96 
 
 
242 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  37.93 
 
 
238 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  36.96 
 
 
242 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  36.96 
 
 
242 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  36.96 
 
 
242 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  36.96 
 
 
242 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  36.96 
 
 
242 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7237  transposase  58.54 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0790  transposase, putative  33.71 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245034  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  35.23 
 
 
251 aa  43.5  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>