More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0170 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0170  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 319 aa  669    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0337001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  30.36 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  36.36 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  36.36 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  35.91 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  35.91 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  35.91 
 
 		 340 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  35.45 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  35.91 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  35.45 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  29.39 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  29.39 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  29.39 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  29.39 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  29.68 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  29.68 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  29.68 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  29.68 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  29.68 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  29.68 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  29.68 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  30.7 
 
 		 237 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  39.29 
 
 		 156 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  30.41 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  37.96 
 
 		 137 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  30.7 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  38.57 
 
 		 156 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  29.77 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  28.64 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  27.73 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  25.89 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  30.11 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  35.37 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  28.98 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  30.54 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  30.77 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  30.41 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  30.22 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  29.55 
 
 		 213 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  30.22 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  30.77 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  30.22 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  24.56 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  27.09 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  27.12 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  26.5 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  28.42 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3224  transposase  25.98 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  27.44 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  27.23 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  29.09 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  29.09 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  30.2 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  29.09 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  29.02 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  28.83 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  29.46 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  28.18 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  28.8 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  25.38 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  26.26 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  29.61 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  26.18 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  29.28 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  26.16 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  28.57 
 
 		 228 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  28.57 
 
 		 228 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  28.48 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  31.06 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  28.28 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  30.32 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1778  transposase  28.86 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.887632  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  27.75 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  28.48 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  25.73 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  27.75 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4096  IS6 family transposase  30 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  31.29 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  29.27 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  27.75 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  23.81 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  26.24 
 
 		 235 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  26.44 
 
 		 255 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  26.37 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  30.95 
 
 		 235 aa  57  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  23.87 
 
 		 233 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  27.78 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  28.26 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  28.26 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  28.26 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  28.26 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  28.26 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  28.26 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0536  putative transposase  24.86 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  31.69 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  28.26 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  28.26 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  28.26 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  28.26 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  28.26 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>