15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5310 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5310  hypothetical protein  100 
 
 
803 aa  1610    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651081  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1757  hypothetical protein  30.06 
 
 
930 aa  334  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1285  hypothetical protein  29.82 
 
 
934 aa  321  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0613  hypothetical protein  24.6 
 
 
1043 aa  235  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2860  hypothetical protein  26.76 
 
 
932 aa  202  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1213  hypothetical protein  26.11 
 
 
908 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0697  hypothetical protein  24.82 
 
 
972 aa  174  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.418548  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2872  hypothetical protein  23.87 
 
 
876 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2567  hypothetical protein  22.39 
 
 
1020 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980048 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0453  OmpA/MotB domain-containing protein  22.97 
 
 
993 aa  110  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.164289  hitchhiker  0.000000000838864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4918  hypothetical protein  20.92 
 
 
880 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0265175  normal  0.302203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3056  hypothetical protein  26.48 
 
 
874 aa  70.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.136617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1303  sporulation related  25.71 
 
 
1096 aa  58.2  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  26.9 
 
 
733 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10368  hypothetical protein  24.87 
 
 
878 aa  53.9  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>