13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5346 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5346  hypothetical protein  100 
 
 		 590 aa  1239    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.696692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2324  hypothetical protein  30.87 
 
 		 608 aa  302  9e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.601755  hitchhiker  0.00265307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3364  hypothetical protein  31.67 
 
 		 594 aa  276  9e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0052  hypothetical protein  27.57 
 
 		 481 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0913  hypothetical protein  27.74 
 
 		 407 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0720256 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0456  conserved hypothetical protein, putative transposase  23.92 
 
 		 489 aa  143  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0084  hypothetical protein  23.7 
 
 		 520 aa  139  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332452  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05117  hypothetical protein  24.31 
 
 		 489 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001248  hypothetical protein  23.55 
 
 		 489 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27761  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2551  hypothetical protein  34.55 
 
 		 128 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2885  hypothetical protein  24.94 
 
 		 788 aa  53.9  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0737968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1540  hypothetical protein  23.09 
 
 		 774 aa  52  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558465  normal  0.0476424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0040  hypothetical protein  20.91 
 
 		 417 aa  43.9  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.204135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>