75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5317 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5317  transposase  100 
 
 		 104 aa  217  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  57.14 
 
 		 488 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  47.83 
 
 		 517 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  45.16 
 
 		 518 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  45.16 
 
 		 518 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  45.16 
 
 		 518 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  48.31 
 
 		 514 aa  84.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  48.31 
 
 		 514 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  48.31 
 
 		 514 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  47.19 
 
 		 514 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  47.19 
 
 		 514 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  47.19 
 
 		 514 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  47.19 
 
 		 514 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  47.19 
 
 		 514 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  47.19 
 
 		 514 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5194  integrase catalytic subunit  56.58 
 
 		 525 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0081  transposase subunit  52.05 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  44.09 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  46.15 
 
 		 516 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  46.15 
 
 		 516 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1736  integrase, catalytic region  46.34 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  50.65 
 
 		 512 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  50.65 
 
 		 512 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1855  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 507 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3594  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 514 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  50.65 
 
 		 512 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  43.82 
 
 		 514 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  52 
 
 		 512 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  43.82 
 
 		 514 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0093  putative transposase for insertion sequence  44.58 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  45.68 
 
 		 385 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  45.68 
 
 		 458 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  40.74 
 
 		 510 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4696  integrase catalytic subunit  42.67 
 
 		 505 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  38.46 
 
 		 513 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  40.82 
 
 		 487 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  38.2 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 517 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  42.5 
 
 		 512 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  43.37 
 
 		 528 aa  57.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  38.27 
 
 		 512 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3248  transposase  41.67 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2791  TRm23a transposase  36.59 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.297528  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 515 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 515 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 515 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 		 515 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  39.02 
 
 		 513 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  39.02 
 
 		 513 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  39.02 
 
 		 513 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  39.02 
 
 		 513 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  39.02 
 
 		 513 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  39.02 
 
 		 513 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  33.7 
 
 		 513 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  37.04 
 
 		 513 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  40.74 
 
 		 517 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  39.13 
 
 		 504 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0180  ISPsy14, transposase  38.67 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0612  integrase catalytic subunit  35.8 
 
 		 472 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  35.21 
 
 		 519 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  35.21 
 
 		 519 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  35.21 
 
 		 519 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  37.84 
 
 		 475 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  32.1 
 
 		 510 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  32.1 
 
 		 510 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  32.1 
 
 		 510 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  32.1 
 
 		 510 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  32.1 
 
 		 539 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  37.23 
 
 		 523 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3593  integrase catalytic subunit  30.86 
 
 		 513 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  35.44 
 
 		 513 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 519 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 519 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 519 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0780  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 432 aa  40.4  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>